67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1909 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  100 
 
 		 87 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  100 
 
 		 87 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  100 
 
 		 87 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  57.47 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  58.14 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  58.14 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  58.14 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  58.14 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  58.14 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  58.14 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  57.47 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  54.65 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  51.16 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0859  Hrp conserved HRCS transmembrane protein  58.54 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0274249  hitchhiker  0.00877367 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  48.28 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  51.28 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  46.91 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  45.68 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  42.25 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  40.51 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  38.16 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03407  HrcS  50.75 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240869  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  33.33 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  46.77 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  36 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  41.79 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42630  putative translocation protein in type III secretion  51.02 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  32.94 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  32.94 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  32.94 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  32.94 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  32.94 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  32.94 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  32.94 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  32.94 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  32.94 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.06 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  35.06 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.49 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  38.81 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.49 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.25 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0738  type III secretion protein, HrpO family  40.96 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.14 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.06 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.49 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.66 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.47 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.62 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.71 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3901  HrpO family type III secretion protein  42.31 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3928  HrpO family type III secretion protein  42.31 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3813  HrpO family type III secretion protein  42.31 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.89 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.71 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.86 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.67 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1884  type III secretion protein, HrpO family  46.77 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.66 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.49 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.03 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.26 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0737  type III secretion protein, HrpO family  39.76 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0357891  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0122  flagellar biosynthetic protein fliQ  39.29 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.86 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.86 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>