279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1364 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  100 
 
 
535 aa  1088    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0263  DNA-cytosine methyltransferase  41.46 
 
 
555 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343546  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1309  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.63 
 
 
539 aa  270  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130072  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1444  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.63 
 
 
539 aa  270  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1222  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.16 
 
 
533 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3912  DNA-cytosine methyltransferase  36.18 
 
 
553 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.286893  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0557  DNA-cytosine methyltransferase  38.17 
 
 
486 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1656  DNA-cytosine methyltransferase  35.86 
 
 
487 aa  233  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  34.82 
 
 
490 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  46.54 
 
 
365 aa  151  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1499  DNA-cytosine methyltransferase  31.46 
 
 
703 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  24.15 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  34.69 
 
 
719 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  26.65 
 
 
437 aa  107  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  35.45 
 
 
315 aa  107  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  33.67 
 
 
719 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.11 
 
 
451 aa  100  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.42 
 
 
328 aa  98.6  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  32.46 
 
 
319 aa  98.6  3e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  33.49 
 
 
490 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 
427 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  29.27 
 
 
324 aa  93.6  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  31.74 
 
 
335 aa  90.5  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  30.36 
 
 
305 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  33.94 
 
 
662 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32 
 
 
362 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  29.19 
 
 
460 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  29.19 
 
 
460 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  37.25 
 
 
372 aa  87.4  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  29.03 
 
 
456 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  29.03 
 
 
456 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
318 aa  86.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 
416 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  35.19 
 
 
385 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  34.44 
 
 
348 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  35.19 
 
 
385 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.31 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.21 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  30.73 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  28.83 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 
335 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  33.09 
 
 
311 aa  82.8  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  31.91 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  35.29 
 
 
321 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  29.38 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  32.05 
 
 
438 aa  79.7  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  29.53 
 
 
350 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  24.74 
 
 
329 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  32.75 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  29.85 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  36.07 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  24.11 
 
 
335 aa  77  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
328 aa  75.9  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.47 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  30.18 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.72 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  33.78 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.6 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.55 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  24.85 
 
 
727 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  27.67 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  29.89 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  30.05 
 
 
657 aa  73.9  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.39 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  25.61 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.8 
 
 
308 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.11 
 
 
435 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  35.85 
 
 
395 aa  73.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  35.61 
 
 
323 aa  72.8  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  30.17 
 
 
370 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.83 
 
 
357 aa  73.6  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  34.06 
 
 
488 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  31.14 
 
 
495 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  32.04 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3531  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.67 
 
 
259 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3814  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.67 
 
 
259 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4216  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.98 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.757892  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  24.85 
 
 
331 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  31.34 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  39.13 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  29.63 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  35.48 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3450  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.28 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189675  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  29.12 
 
 
502 aa  70.5  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  38.32 
 
 
373 aa  70.1  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
483 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  33.94 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  34.48 
 
 
446 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>