More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1430 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  100 
 
 
154 aa  313  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  93.24 
 
 
148 aa  279  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  92.52 
 
 
174 aa  277  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  92.52 
 
 
174 aa  277  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  92.36 
 
 
171 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  94.33 
 
 
146 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  92.13 
 
 
154 aa  237  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  91.34 
 
 
154 aa  237  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  53.96 
 
 
132 aa  150  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  59.5 
 
 
124 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  58.41 
 
 
127 aa  145  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  59.17 
 
 
121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  58.47 
 
 
135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  55.17 
 
 
125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  62.39 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  58.04 
 
 
125 aa  135  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  47.41 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  47.46 
 
 
133 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  52.29 
 
 
151 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  53.51 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  47.41 
 
 
121 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  48.65 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  50.46 
 
 
272 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  44.06 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  45.13 
 
 
128 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  49.11 
 
 
144 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  47.79 
 
 
129 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  46.15 
 
 
144 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  49.11 
 
 
148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
134 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  46.22 
 
 
146 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  49.54 
 
 
163 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  46.4 
 
 
137 aa  113  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  46.72 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  49.07 
 
 
122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  48.62 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  46.9 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  48.65 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  44.54 
 
 
131 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  54 
 
 
125 aa  110  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  51.43 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 
170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  50.96 
 
 
130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  53.19 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  51.4 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  42.98 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  49.07 
 
 
137 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
135 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 
133 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  50.83 
 
 
168 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 
135 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 
133 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  46.22 
 
 
134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  47.32 
 
 
144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 
130 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 
150 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
135 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  44 
 
 
135 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  47.41 
 
 
130 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 
136 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 
135 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  38.98 
 
 
126 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
144 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 
128 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 
135 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
134 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
131 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 
135 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  40.83 
 
 
130 aa  104  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
121 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  48.6 
 
 
126 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  49.48 
 
 
101 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
108 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 
135 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  48.11 
 
 
128 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  51.58 
 
 
136 aa  103  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  48.57 
 
 
125 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  46.85 
 
 
126 aa  103  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  41.74 
 
 
126 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  41.53 
 
 
126 aa  103  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  37.78 
 
 
154 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
140 aa  103  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
124 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  36.43 
 
 
142 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  46.09 
 
 
154 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 
138 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 
143 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  40.87 
 
 
144 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  45.22 
 
 
119 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
133 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  41.07 
 
 
138 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  48.18 
 
 
128 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
128 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>