More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1084 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1084  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  100 
 
 
539 aa  1112    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0164  extracellular solute-binding protein family 5  29.61 
 
 
550 aa  178  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
534 aa  173  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 
520 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  31.61 
 
 
507 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 
564 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 
510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
529 aa  154  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0927  extracellular solute-binding protein family 5  29.39 
 
 
544 aa  154  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.887829  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.16 
 
 
508 aa  153  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 
525 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 
520 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.68 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 
537 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 
518 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
505 aa  146  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
522 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  27.25 
 
 
522 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  29.24 
 
 
523 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
522 aa  144  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 
530 aa  144  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
546 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  28.82 
 
 
512 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  28.82 
 
 
512 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  28.82 
 
 
512 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  28.82 
 
 
512 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  28.57 
 
 
512 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.04 
 
 
512 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.04 
 
 
512 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.04 
 
 
512 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 
512 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.04 
 
 
512 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 
520 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.61 
 
 
540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.79 
 
 
512 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
504 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 
514 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 
512 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  30.22 
 
 
521 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  28.79 
 
 
512 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 
517 aa  136  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  27.38 
 
 
528 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  28.86 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.38 
 
 
550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 
528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  26.89 
 
 
514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
543 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
520 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
520 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.68 
 
 
493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.25 
 
 
520 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.25 
 
 
520 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.25 
 
 
520 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
534 aa  134  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  28.25 
 
 
520 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
521 aa  134  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.25 
 
 
520 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.25 
 
 
520 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.25 
 
 
520 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
520 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  28.11 
 
 
520 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
534 aa  133  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
529 aa  133  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.1 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  28.98 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  29.58 
 
 
537 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 
509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.38 
 
 
535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 
556 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 
536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 
556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 
547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 
534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 
547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.78 
 
 
542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 
516 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
518 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 
514 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
520 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
525 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
521 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 
531 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2113  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.51 
 
 
539 aa  130  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
512 aa  130  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  28.13 
 
 
508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 
522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
544 aa  128  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
528 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 
521 aa  128  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 
531 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
538 aa  128  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
528 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>