74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1785 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1785  cell wall-associated hydrolase  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0914  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  36.32 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0797  NLP/P60 protein  46.53 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  28.37 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2336  hypothetical protein  36.96 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.354341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 366 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  28.24 
 
 		 371 aa  49.7  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  33.63 
 
 		 536 aa  48.5  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  29.17 
 
 		 343 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  29.65 
 
 		 319 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  26.06 
 
 		 337 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  39.19 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  25.65 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2065  Peptidoglycan-binding LysM  33.87 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  28.95 
 
 		 331 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 393 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  26.47 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  32.89 
 
 		 335 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  31.06 
 
 		 472 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  27.55 
 
 		 333 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  26.42 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  28.18 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  26.95 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  30.97 
 
 		 532 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  30.4 
 
 		 293 aa  45.4  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  27.69 
 
 		 478 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  32 
 
 		 364 aa  45.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4425  hypothetical protein  32.22 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  31.03 
 
 		 453 aa  45.1  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  27.83 
 
 		 177 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  29.13 
 
 		 475 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  26.92 
 
 		 472 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  34.48 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  29.13 
 
 		 475 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 345 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  29.13 
 
 		 475 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  32.79 
 
 		 334 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  29.89 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 371 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  24.28 
 
 		 340 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  31.73 
 
 		 532 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  27.69 
 
 		 479 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  27.31 
 
 		 327 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  23.78 
 
 		 342 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  27.27 
 
 		 1048 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  26.06 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  30.59 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  25.47 
 
 		 341 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  27.03 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  31.18 
 
 		 436 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  31.18 
 
 		 436 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  31.18 
 
 		 436 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  34.88 
 
 		 447 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  26.26 
 
 		 553 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  28.77 
 
 		 319 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  31.45 
 
 		 323 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  32.67 
 
 		 556 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  26.61 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  30 
 
 		 253 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  31.31 
 
 		 289 aa  42  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  26.35 
 
 		 231 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  26.32 
 
 		 517 aa  42  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  29.33 
 
 		 350 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  25.15 
 
 		 242 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1192  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 365 aa  41.6  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.058782  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  29.41 
 
 		 372 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  28.7 
 
 		 432 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 372 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  26.12 
 
 		 467 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 372 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  26.12 
 
 		 467 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>