More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4797 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  100 
 
 		 498 aa  997    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  67.47 
 
 		 498 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  57.66 
 
 		 492 aa  504  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  50.3 
 
 		 495 aa  472  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  49.16 
 
 		 507 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  48.24 
 
 		 507 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  50.21 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  50.52 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  48.87 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  51.44 
 
 		 508 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  49.18 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  49.18 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  48.45 
 
 		 507 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  46.71 
 
 		 522 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  46.81 
 
 		 506 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  41.51 
 
 		 477 aa  340  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  44.06 
 
 		 475 aa  340  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  40.59 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  42.24 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  45.85 
 
 		 463 aa  322  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  42.58 
 
 		 466 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  44.78 
 
 		 482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  46.12 
 
 		 472 aa  303  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.83 
 
 		 479 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  43.33 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  43.38 
 
 		 468 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  42.92 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  43.47 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  42.48 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  42.76 
 
 		 477 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  40.95 
 
 		 490 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  40.73 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  39.79 
 
 		 494 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  39.79 
 
 		 494 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  39.79 
 
 		 494 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  39.36 
 
 		 494 aa  279  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  39.83 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  39.62 
 
 		 494 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  38.95 
 
 		 472 aa  269  8e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  38.51 
 
 		 494 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  37.58 
 
 		 487 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  37.58 
 
 		 494 aa  263  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  40.59 
 
 		 481 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  39.75 
 
 		 521 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  37.94 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  38.74 
 
 		 471 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  37.34 
 
 		 480 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  38.89 
 
 		 458 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  37.29 
 
 		 480 aa  246  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  36.07 
 
 		 485 aa  246  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  37.42 
 
 		 495 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  40.34 
 
 		 459 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  35.91 
 
 		 494 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  38.44 
 
 		 481 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  36.04 
 
 		 491 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  36.53 
 
 		 485 aa  243  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37.63 
 
 		 473 aa  242  9e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  38.43 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  36.07 
 
 		 485 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  39.14 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  36.94 
 
 		 556 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  35.7 
 
 		 485 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  37.85 
 
 		 485 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  35.42 
 
 		 485 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  37.93 
 
 		 497 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  35.43 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  37.47 
 
 		 486 aa  224  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  36.38 
 
 		 494 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  36.46 
 
 		 484 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  36.46 
 
 		 484 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  36.46 
 
 		 484 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.52 
 
 		 463 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  36.46 
 
 		 484 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  36.46 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  36.46 
 
 		 546 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  36.46 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  36.42 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  36.34 
 
 		 469 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.5 
 
 		 463 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  34.26 
 
 		 492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  33.83 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  36.34 
 
 		 469 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  34.72 
 
 		 471 aa  213  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  34.37 
 
 		 499 aa  213  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.13 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  36.13 
 
 		 469 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.57 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  35.12 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  35.94 
 
 		 461 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  33.69 
 
 		 475 aa  210  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  34.4 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  35.16 
 
 		 495 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.66 
 
 		 505 aa  206  8e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  34.41 
 
 		 475 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  35.82 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.17 
 
 		 485 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  32.55 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.02 
 
 		 486 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  35.02 
 
 		 470 aa  203  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  34.42 
 
 		 469 aa  202  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>