More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4077 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  100 
 
 		 475 aa  928    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 452 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 452 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 453 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 450 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  44.34 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  44.34 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  44.34 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  44.34 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  44.34 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  44.34 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  44.11 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  45.03 
 
 		 454 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  42.79 
 
 		 454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  43.65 
 
 		 579 aa  326  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  44.05 
 
 		 454 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  41.82 
 
 		 455 aa  316  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 457 aa  299  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 453 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 453 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  43.42 
 
 		 453 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 453 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  38.83 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  43.76 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 453 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  38.51 
 
 		 448 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  39.27 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  40.91 
 
 		 452 aa  286  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 465 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  39.57 
 
 		 452 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  38.29 
 
 		 448 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  40.81 
 
 		 458 aa  279  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 449 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  44.7 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 468 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  39.57 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  43.39 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 449 aa  273  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  36.74 
 
 		 441 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  40.95 
 
 		 465 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 		 452 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 460 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 460 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  38.18 
 
 		 447 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  41.52 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 454 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  36.95 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  37.44 
 
 		 451 aa  262  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  38.44 
 
 		 449 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  38.12 
 
 		 452 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  40.53 
 
 		 452 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  40.53 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  40.53 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  40.53 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 459 aa  256  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 452 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 467 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  38.88 
 
 		 458 aa  252  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  38.88 
 
 		 448 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 450 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  43.64 
 
 		 448 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  38.88 
 
 		 448 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  38.05 
 
 		 446 aa  250  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 457 aa  249  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  37.94 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  39.96 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  34 
 
 		 458 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 456 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 452 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2625  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  36.71 
 
 		 466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000676448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4528  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  36.71 
 
 		 466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000028085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2748  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  37.56 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>