More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2028 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  100 
 
 
570 aa  1133    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  64.27 
 
 
586 aa  723    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.79 
 
 
549 aa  286  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  37.27 
 
 
550 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.64 
 
 
557 aa  267  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  33.27 
 
 
550 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  35.24 
 
 
548 aa  264  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  36.18 
 
 
540 aa  256  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  34.4 
 
 
847 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  34.51 
 
 
540 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  33.39 
 
 
847 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.4 
 
 
568 aa  253  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  33.88 
 
 
547 aa  249  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  35.19 
 
 
553 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.08 
 
 
568 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.46 
 
 
573 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.96 
 
 
586 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1073  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.64 
 
 
586 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0677257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1015  thiamine pyrophosphate enzyme  35.34 
 
 
586 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  33.93 
 
 
559 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  30.77 
 
 
640 aa  240  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.92 
 
 
574 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2104  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.56 
 
 
588 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  31.48 
 
 
582 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2478  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  34.54 
 
 
585 aa  216  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  33.09 
 
 
551 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  28.26 
 
 
567 aa  201  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2332  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.58 
 
 
588 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428788  normal  0.0160517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2293  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  31.45 
 
 
570 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2340  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.45 
 
 
570 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.425304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4487  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.66 
 
 
609 aa  199  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.58 
 
 
563 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10119  putative oxalyl-CoA decarboxylase  31.12 
 
 
582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.11 
 
 
562 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  28.47 
 
 
574 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.44 
 
 
572 aa  197  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.8 
 
 
573 aa  196  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  31.33 
 
 
549 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.5 
 
 
574 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.21 
 
 
576 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.84 
 
 
620 aa  195  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.32 
 
 
553 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.31 
 
 
579 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.88 
 
 
581 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.62 
 
 
535 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.96 
 
 
554 aa  194  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10214  2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05230)  28.6 
 
 
605 aa  193  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00157482  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.27 
 
 
574 aa  193  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.74 
 
 
577 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08530  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.64 
 
 
633 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0564947  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 
562 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3155  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  31.58 
 
 
550 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.96 
 
 
572 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  31.02 
 
 
578 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.47 
 
 
561 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3892  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.95 
 
 
550 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.0243729 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.94 
 
 
581 aa  192  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.99 
 
 
573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.96 
 
 
572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.68 
 
 
580 aa  191  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.19 
 
 
552 aa  191  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.96 
 
 
572 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.26 
 
 
588 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.24 
 
 
559 aa  190  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.1 
 
 
581 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.08 
 
 
584 aa  190  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.24 
 
 
557 aa  190  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.7 
 
 
555 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.75 
 
 
564 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.85 
 
 
574 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2523  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.31 
 
 
564 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.85 
 
 
574 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.79 
 
 
572 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.63 
 
 
574 aa  188  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.61 
 
 
572 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.85 
 
 
574 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.43 
 
 
572 aa  187  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.75 
 
 
598 aa  187  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42520  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.94 
 
 
574 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  26.8 
 
 
566 aa  186  8e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.26 
 
 
572 aa  186  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.77 
 
 
586 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3099  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  31.52 
 
 
579 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.43 
 
 
572 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.4 
 
 
581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  29.4 
 
 
566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2661  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.31 
 
 
564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.86 
 
 
573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.26 
 
 
572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.03 
 
 
566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1296  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.57 
 
 
564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02283  hypothetical protein  28.31 
 
 
564 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1284  oxalyl-CoA decarboxylase  28.31 
 
 
564 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  28.5 
 
 
562 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0501  acetolactate synthase, large subunit  28.32 
 
 
585 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02244  hypothetical protein  28.31 
 
 
564 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2510  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.31 
 
 
564 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.397201  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2742  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.31 
 
 
564 aa  184  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6740  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.49 
 
 
580 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.766112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3605  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.31 
 
 
564 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.376687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>