147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1599 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  55.17 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  54.44 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  52.81 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  51.61 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  61.25 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  54.55 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  54.35 
 
 		 107 aa  95.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  54.35 
 
 		 107 aa  95.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  48.91 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  55.17 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  49.46 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  48.39 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  52.17 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  51.09 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  48.35 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  53.01 
 
 		 106 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  48.35 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  53.41 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  48.91 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  50 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  47.83 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  46.24 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  51.19 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  47.83 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  46.07 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  51.85 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  51.09 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  47.5 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  47.06 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  51.76 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  46.67 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  47.19 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  52.44 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  42.53 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  41.38 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  45.45 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  53.66 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  44.57 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  47.5 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  44.44 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  42.53 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  39.08 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  44.83 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  48.72 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  39.08 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  37.93 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  40.23 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  42.53 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  39.29 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  38.04 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  44.83 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  37.93 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  40.74 
 
 		 106 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  43.02 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  42.35 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  50.77 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  38.75 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  41.57 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  42.35 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  37.93 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  43.59 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  37.78 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  39.77 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16510  ferredoxin  38.64 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  40.91 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  38.75 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  38.71 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  42.31 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  39.33 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0142  ferredoxin  44.62 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  40.23 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  38.1 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  38.1 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  38.1 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  36.08 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  37.37 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  37.37 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  33.73 
 
 		 445 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  32.97 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  38.57 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  33.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.75 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.75 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.75 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.75 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.24 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.24 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.24 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.24 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  38.75 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  38.67 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>