More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0674 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0674  putative fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 533 aa  1103    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.11643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3261  AMP-dependent synthetase and ligase  82.42 
 
 		 534 aa  932    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  82.36 
 
 		 533 aa  917    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0351635  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2203  AMP-dependent synthetase and ligase  81.85 
 
 		 534 aa  925    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  81.25 
 
 		 534 aa  910    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  54.72 
 
 		 528 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  54.72 
 
 		 528 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  44.05 
 
 		 536 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0322  AMP-dependent synthetase and ligase  39.58 
 
 		 531 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  41.49 
 
 		 540 aa  360  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1027  AMP-dependent synthetase and ligase  39.05 
 
 		 539 aa  351  1e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0505944  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1984  AMP-dependent synthetase and ligase  38.85 
 
 		 552 aa  332  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  39.65 
 
 		 534 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 		 532 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  37.6 
 
 		 529 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  37.6 
 
 		 516 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  37.4 
 
 		 522 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  36.49 
 
 		 537 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  36.49 
 
 		 537 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  36.49 
 
 		 537 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 		 517 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 530 aa  301  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 511 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  37.26 
 
 		 521 aa  295  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  36.19 
 
 		 520 aa  295  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 520 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  36.81 
 
 		 529 aa  290  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  35.36 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 525 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 518 aa  283  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  36.36 
 
 		 513 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.74 
 
 		 524 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 512 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 521 aa  276  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 499 aa  274  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 509 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 516 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 515 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  34.43 
 
 		 565 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.95 
 
 		 519 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 518 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.1 
 
 		 514 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 515 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  33.92 
 
 		 522 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 520 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 519 aa  265  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 515 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 530 aa  263  8e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 521 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 515 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  33.58 
 
 		 557 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 557 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  34.31 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 517 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 539 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.89 
 
 		 503 aa  260  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 562 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 1043 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 562 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  32.42 
 
 		 576 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3222  acyl-CoA synthetase  33.84 
 
 		 550 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831142  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 528 aa  257  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4071  acyl-CoA synthetase  33.84 
 
 		 550 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4295  acyl-CoA synthetase  33.84 
 
 		 550 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.75 
 
 		 530 aa  257  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 493 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  32.97 
 
 		 557 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 525 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 		 582 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  32.24 
 
 		 576 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2052  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 523 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 		 518 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 524 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 511 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4191  acyl-CoA synthetase  33.65 
 
 		 550 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3713  acyl-CoA synthetase  33.46 
 
 		 550 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0606  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 560 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 525 aa  253  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  32.34 
 
 		 549 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  31.48 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  31.83 
 
 		 560 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 564 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 531 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 565 aa  249  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.01 
 
 		 517 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.01 
 
 		 517 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.01 
 
 		 517 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 527 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 559 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  31.24 
 
 		 571 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 526 aa  247  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1394  acyl-CoA synthetase  32.51 
 
 		 553 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 534 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1076  acyl-CoA synthetase  32.5 
 
 		 553 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0509  acyl-CoA synthetase  32.51 
 
 		 553 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 508 aa  247  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1724  acyl-CoA synthetase  33.78 
 
 		 556 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>