More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34920 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  79.67 
 
 
497 aa  811    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  76.42 
 
 
498 aa  757    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  76.42 
 
 
498 aa  753    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  75.25 
 
 
544 aa  780    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  998    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  79.47 
 
 
504 aa  804    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  82.35 
 
 
496 aa  836    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  75.66 
 
 
496 aa  782    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  78.86 
 
 
497 aa  804    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  77.03 
 
 
497 aa  791    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  79.47 
 
 
497 aa  810    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  57.09 
 
 
501 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  59.15 
 
 
495 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  56.19 
 
 
492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  54.56 
 
 
497 aa  547  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  57.26 
 
 
521 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  49.4 
 
 
493 aa  479  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  49.9 
 
 
497 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.8 
 
 
534 aa  457  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.82 
 
 
499 aa  455  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  47.76 
 
 
491 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  47.14 
 
 
496 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  44.94 
 
 
490 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  47.08 
 
 
495 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  43.69 
 
 
494 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  41.37 
 
 
497 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  40.04 
 
 
486 aa  368  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  39.44 
 
 
496 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  39.44 
 
 
496 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  38.28 
 
 
496 aa  351  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.43 
 
 
502 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  37.06 
 
 
549 aa  342  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  37.29 
 
 
532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  37.14 
 
 
494 aa  335  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  36.91 
 
 
535 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  36.79 
 
 
490 aa  333  6e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  34.6 
 
 
498 aa  316  6e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  37.18 
 
 
556 aa  311  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  34.18 
 
 
549 aa  302  8.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  36.13 
 
 
556 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.61 
 
 
551 aa  299  9e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  33.48 
 
 
492 aa  294  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  34.25 
 
 
578 aa  292  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  33.77 
 
 
474 aa  269  8.999999999999999e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  50.65 
 
 
288 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  51.82 
 
 
609 aa  228  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.48 
 
 
267 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.48 
 
 
267 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  46.35 
 
 
270 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  47.33 
 
 
259 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  46.25 
 
 
308 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  46.15 
 
 
270 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  45.34 
 
 
270 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  45.34 
 
 
270 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  45.34 
 
 
270 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  45.34 
 
 
270 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  45.34 
 
 
254 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  45.34 
 
 
254 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  47.44 
 
 
270 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  51.02 
 
 
264 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  50 
 
 
258 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  46.82 
 
 
261 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  44.93 
 
 
263 aa  187  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  40.43 
 
 
279 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  39.34 
 
 
307 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  39.38 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  36.32 
 
 
263 aa  163  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  38.39 
 
 
338 aa  163  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  40.47 
 
 
318 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  35.84 
 
 
262 aa  161  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  38.79 
 
 
393 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  35.54 
 
 
289 aa  160  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  42.47 
 
 
324 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  38.79 
 
 
303 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  39.29 
 
 
365 aa  160  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  39.27 
 
 
326 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  41.49 
 
 
310 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  39.27 
 
 
331 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  40.84 
 
 
340 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  38.99 
 
 
322 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  34.9 
 
 
294 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  39.27 
 
 
326 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  39.63 
 
 
305 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0718  protein of unknown function DUF344  41.05 
 
 
260 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15403  normal  0.613775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  37.9 
 
 
367 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  38.1 
 
 
328 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  39.07 
 
 
316 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  37.1 
 
 
256 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  39.45 
 
 
304 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  42.39 
 
 
391 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  38.33 
 
 
305 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  41.4 
 
 
337 aa  157  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  38.12 
 
 
304 aa  157  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  38.12 
 
 
304 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  41.49 
 
 
308 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  40.1 
 
 
304 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  40.53 
 
 
324 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  41.49 
 
 
308 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  41.49 
 
 
308 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  40.53 
 
 
329 aa  157  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>