More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09960 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  87.97 
 
 		 169 aa  288  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  87.97 
 
 		 159 aa  286  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  84.81 
 
 		 159 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  84.81 
 
 		 158 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  84.81 
 
 		 158 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  84.81 
 
 		 158 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  84.81 
 
 		 158 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  83.65 
 
 		 159 aa  268  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  82.39 
 
 		 159 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  82.28 
 
 		 163 aa  265  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  62.58 
 
 		 165 aa  202  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  64.1 
 
 		 172 aa  197  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  65.36 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  65.36 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  59.87 
 
 		 157 aa  187  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  62 
 
 		 169 aa  184  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  59.48 
 
 		 158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  61.84 
 
 		 161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  60.26 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  55.84 
 
 		 157 aa  180  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  55.19 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 156 aa  176  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 157 aa  167  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  52.26 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 166 aa  156  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 161 aa  156  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  48.68 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  48.68 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  48.68 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  48.68 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  48.68 
 
 		 229 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 202 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  48.03 
 
 		 229 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 175 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  49.03 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 169 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 213 aa  140  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.08 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  47.68 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 154 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 152 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.75 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  48.68 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  45.39 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>