83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09490 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_09490  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 121 aa  244  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0634  transcription regulator protein  74.79 
 
 		 318 aa  190  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2748  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 		 318 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0720  transcriptional regulator, LysR family  56.3 
 
 		 319 aa  133  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0967  transcriptional regulator, LysR family  51.26 
 
 		 325 aa  124  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336861  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 310 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1672  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 288 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1940  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 288 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4317  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135379  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  34.31 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3808  transcriptional regulator LysR family  26.67 
 
 		 309 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3875  putative transcriptional regulator  27.52 
 
 		 307 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656109  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 313 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 305 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4582  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 303 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00622026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5723  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 303 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2405  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 345 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3786  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 303 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6020  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 310 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30990  Transcriptional regulator LysR family protein  30.39 
 
 		 309 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0885  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 288 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 299 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  25.49 
 
 		 307 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5557  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 345 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5786  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 345 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 301 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2342  transcriptional regulator, LysR family  29 
 
 		 344 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0120  LysR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 297 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 289 aa  42.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  27.45 
 
 		 289 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1262  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414477  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1472  transcription regulator protein  34.78 
 
 		 318 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.458682  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4009  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 311 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4471  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 300 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190503  normal  0.801309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0828  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1615  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 298 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86393  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4162  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 298 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3487  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.42 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0261  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 310 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 		 314 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 		 314 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 295 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0231  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 298 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 304 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  26.73 
 
 		 289 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  30.3 
 
 		 315 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 298 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 306 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4348  transcriptional regulator, LysR family  34.07 
 
 		 297 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3130  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 312 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.171352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 298 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02290  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 311 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.107615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4579  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 296 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5034  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 308 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 302 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15310  transcriptional regulatory protein, LysR family  31.58 
 
 		 318 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.313751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  27.55 
 
 		 297 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 289 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4613  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 		 296 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565718 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0028  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  27.88 
 
 		 290 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1619  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 303 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal  0.542444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0259  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 330 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 299 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 299 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0994  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 303 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 299 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>