More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4196 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4196  cell division particle  100 
 
 		 454 aa  899    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.701722  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4069  signal recognition particle-docking protein FtsY  83.05 
 
 		 533 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.605645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  77.14 
 
 		 528 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3091  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.42 
 
 		 520 aa  539  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.694563 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0925  signal recognition particle-docking protein FtsY  79.48 
 
 		 494 aa  497  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1861  cell division protein FtsY  57.52 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229627  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1934  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.34 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3389  signal recognition particle-docking protein FtsY  78.69 
 
 		 500 aa  488  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0017  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.96 
 
 		 387 aa  465  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.278591  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.79 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0413  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.37 
 
 		 529 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.571496  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.47 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2950  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.82 
 
 		 488 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260236  hitchhiker  0.00455351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5338  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.01 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.870799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2723  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.82 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0207  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.43 
 
 		 315 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0361  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.94 
 
 		 408 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.29 
 
 		 473 aa  392  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1181  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.91 
 
 		 506 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0879214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0402  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.83 
 
 		 315 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0316  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  62.5 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0362  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.14 
 
 		 315 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0212  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.81 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0517  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.81 
 
 		 315 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0375  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.49 
 
 		 315 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1413  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.34 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3223  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.89 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.7 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0977518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1843  Signal recognition particle-docking protein FtsY  58.7 
 
 		 393 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.84 
 
 		 346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0632  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.33 
 
 		 410 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.56 
 
 		 386 aa  332  6e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1214  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.63 
 
 		 381 aa  331  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2496  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.67 
 
 		 312 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0521  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.33 
 
 		 326 aa  322  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.948166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2853  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.55 
 
 		 309 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2725  hypothetical protein  55.43 
 
 		 499 aa  320  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2930  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.48 
 
 		 311 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4860  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.31 
 
 		 314 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2732  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.64 
 
 		 308 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.5 
 
 		 485 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.36 
 
 		 481 aa  307  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.43 
 
 		 540 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.11 
 
 		 611 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.11 
 
 		 615 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.64 
 
 		 584 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.11 
 
 		 621 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 562 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  50.64 
 
 		 510 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.63 
 
 		 482 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  50.8 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 		 477 aa  300  5e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.77 
 
 		 510 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.44 
 
 		 487 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 		 582 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1400  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.99 
 
 		 308 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  50.48 
 
 		 563 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.51 
 
 		 452 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.65 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.01 
 
 		 561 aa  296  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.52 
 
 		 540 aa  295  8e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 513 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.17 
 
 		 478 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  50.83 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.74 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.49 
 
 		 587 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.15 
 
 		 494 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  47.9 
 
 		 471 aa  293  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  47.9 
 
 		 495 aa  292  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.69 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.76 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.67 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 514 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  47.44 
 
 		 541 aa  289  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  49.19 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.09 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.77 
 
 		 501 aa  285  8e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.76 
 
 		 351 aa  285  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  48.73 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.95 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 643 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  49.18 
 
 		 362 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.17 
 
 		 447 aa  283  5.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 329 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.81 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.03 
 
 		 523 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  49.03 
 
 		 541 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  49.03 
 
 		 553 aa  280  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.68 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.23 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.8 
 
 		 340 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.15 
 
 		 342 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0888  cell division ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein FtsY  48 
 
 		 303 aa  275  2.0000000000000002e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.52 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  47.25 
 
 		 511 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  47.91 
 
 		 491 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.06 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>