More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1718 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 381 aa  764    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  56.75 
 
 		 350 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.58 
 
 		 351 aa  356  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.21 
 
 		 340 aa  348  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.97 
 
 		 342 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.83 
 
 		 320 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.95 
 
 		 312 aa  328  9e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.61 
 
 		 319 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3297  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.82 
 
 		 409 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.03 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0964  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.52 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0490186  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.03 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.07 
 
 		 373 aa  316  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3317  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.93 
 
 		 381 aa  315  8e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00314422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.63 
 
 		 326 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.39 
 
 		 375 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.15 
 
 		 510 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.64 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.18 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.15 
 
 		 301 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0708  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.85 
 
 		 469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.14 
 
 		 302 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  47.76 
 
 		 408 aa  306  6e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0707  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.85 
 
 		 469 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.02 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  51.31 
 
 		 471 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.71 
 
 		 514 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  51.63 
 
 		 495 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.82 
 
 		 309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.52 
 
 		 451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  52.16 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.12 
 
 		 432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  47.9 
 
 		 505 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  54 
 
 		 465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 320 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.57 
 
 		 491 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.23 
 
 		 494 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.59 
 
 		 302 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.97 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.74 
 
 		 497 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.86 
 
 		 452 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 		 561 aa  300  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 501 aa  300  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2354  cell division membrane protein  53.27 
 
 		 472 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000763762  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4170  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.71 
 
 		 313 aa  299  5e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.56 
 
 		 481 aa  299  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  51.51 
 
 		 311 aa  299  7e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.97 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 		 513 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.86 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  49.19 
 
 		 541 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 540 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.24 
 
 		 535 aa  295  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.67 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  50.67 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.67 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.67 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 320 aa  295  9e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  50.67 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.67 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  50.32 
 
 		 563 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.4 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.67 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0560  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 506 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000445569  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  50.47 
 
 		 541 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.12 
 
 		 475 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.71 
 
 		 523 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 329 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  42.6 
 
 		 362 aa  293  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  51 
 
 		 329 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  51.29 
 
 		 408 aa  291  9e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 		 318 aa  291  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 611 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  50.16 
 
 		 553 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1976  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  51.43 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.53 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.84 
 
 		 320 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.38 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 621 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.87 
 
 		 335 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 615 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1680  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 444 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.990278  normal  0.232979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0962  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.48 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1214  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.54 
 
 		 381 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  50.97 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 540 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07270  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.6 
 
 		 322 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000016594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  47.8 
 
 		 498 aa  289  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  51.62 
 
 		 447 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  47.8 
 
 		 498 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 		 643 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  47.8 
 
 		 498 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  47.8 
 
 		 498 aa  289  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  49 
 
 		 329 aa  289  6e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  47.8 
 
 		 498 aa  289  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>