More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1400 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1400  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 308 aa  605  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324422  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2732  signal recognition particle-docking protein FtsY  77.1 
 
 		 308 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2930  signal recognition particle-docking protein FtsY  74.03 
 
 		 311 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0207  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.62 
 
 		 315 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.82 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0375  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.97 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0517  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.49 
 
 		 315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.82 
 
 		 473 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0402  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.13 
 
 		 315 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0316  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  52.81 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0632  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.93 
 
 		 410 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2725  hypothetical protein  56.88 
 
 		 499 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0212  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.49 
 
 		 316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1843  Signal recognition particle-docking protein FtsY  56.93 
 
 		 393 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0361  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.3 
 
 		 408 aa  309  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0925  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.64 
 
 		 494 aa  309  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.93 
 
 		 379 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0977518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0362  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.5 
 
 		 315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2723  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.15 
 
 		 488 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.3 
 
 		 346 aa  305  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2950  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 488 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260236  hitchhiker  0.00455351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.45 
 
 		 386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_004310  BR1934  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.97 
 
 		 463 aa  301  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1861  cell division protein FtsY  53.97 
 
 		 465 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229627  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 493 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1214  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.45 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3091  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.98 
 
 		 520 aa  298  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.694563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3223  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.16 
 
 		 483 aa  298  7e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124674 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0017  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.17 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.278591  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3389  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.16 
 
 		 500 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5338  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.83 
 
 		 466 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.870799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4069  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.99 
 
 		 533 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.605645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1413  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.49 
 
 		 316 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1181  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.03 
 
 		 506 aa  292  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0879214  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.66 
 
 		 528 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2496  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.85 
 
 		 312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4196  cell division particle  51.99 
 
 		 454 aa  281  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.701722  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0413  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 529 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.571496  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0521  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.67 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.948166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.19 
 
 		 501 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.66 
 
 		 514 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.8 
 
 		 405 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.33 
 
 		 497 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.33 
 
 		 494 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.33 
 
 		 510 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.42 
 
 		 326 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.76 
 
 		 485 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.03 
 
 		 513 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  51.03 
 
 		 505 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0889  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.9 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  49.32 
 
 		 362 aa  263  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4860  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0888  cell division ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein FtsY  46.74 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.77 
 
 		 373 aa  262  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.3 
 
 		 309 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.88 
 
 		 416 aa  262  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.88 
 
 		 416 aa  262  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.14 
 
 		 561 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.18 
 
 		 453 aa  261  6.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4170  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.43 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.02 
 
 		 432 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.55 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  44.22 
 
 		 408 aa  259  4e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.58 
 
 		 478 aa  259  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.58 
 
 		 477 aa  259  4e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.64 
 
 		 375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.07 
 
 		 515 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.24 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  46 
 
 		 397 aa  257  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1111  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.56 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.626462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.47 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.28 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.56 
 
 		 451 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.97 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2853  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.84 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1055  cell division protein  46 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  47.3 
 
 		 541 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  47.1 
 
 		 563 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  51.37 
 
 		 447 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  50.34 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  46.69 
 
 		 471 aa  255  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.38 
 
 		 376 aa  255  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  47.21 
 
 		 324 aa  255  6e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.28 
 
 		 340 aa  255  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.84 
 
 		 329 aa  255  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.33 
 
 		 483 aa  255  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1157  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.19 
 
 		 508 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000684917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.36 
 
 		 475 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.44 
 
 		 562 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.08 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2108  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.89 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.92 
 
 		 643 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.05 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.1 
 
 		 584 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.12 
 
 		 540 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  48.3 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  47.78 
 
 		 671 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  46.8 
 
 		 495 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  47.1 
 
 		 510 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.59 
 
 		 587 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>