More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0207 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0207  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 315 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0362  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.42 
 
 		 315 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0517  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.42 
 
 		 315 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0212  signal recognition particle-docking protein FtsY  85.99 
 
 		 316 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0402  signal recognition particle-docking protein FtsY  81.59 
 
 		 315 aa  510  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0316  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  79.3 
 
 		 315 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0375  signal recognition particle-docking protein FtsY  79.3 
 
 		 315 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0413  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.34 
 
 		 529 aa  447  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.571496  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3223  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.28 
 
 		 483 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.84 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.18 
 
 		 473 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0361  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.95 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2723  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.54 
 
 		 488 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2950  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.54 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260236  hitchhiker  0.00455351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.33 
 
 		 493 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5338  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.51 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.870799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3091  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.34 
 
 		 520 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.694563 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0925  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.28 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1934  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.03 
 
 		 463 aa  388  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1861  cell division protein FtsY  64.03 
 
 		 465 aa  388  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229627  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3389  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.73 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0017  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.32 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.278591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4069  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.31 
 
 		 533 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.605645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.98 
 
 		 528 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1413  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.71 
 
 		 316 aa  371  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4196  cell division particle  63.7 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.701722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1181  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.61 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0879214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2496  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.46 
 
 		 312 aa  342  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.02 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0632  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.27 
 
 		 410 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1843  Signal recognition particle-docking protein FtsY  58.27 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2725  hypothetical protein  58.48 
 
 		 499 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.27 
 
 		 379 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0977518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2930  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.35 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1214  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.91 
 
 		 381 aa  335  5e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2853  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.21 
 
 		 309 aa  335  7e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.21 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2732  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.12 
 
 		 308 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1400  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.62 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.7 
 
 		 481 aa  312  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0521  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.33 
 
 		 326 aa  308  8e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.948166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.37 
 
 		 453 aa  306  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.31 
 
 		 510 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.31 
 
 		 497 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.31 
 
 		 494 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.14 
 
 		 405 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.4 
 
 		 478 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.49 
 
 		 514 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.72 
 
 		 477 aa  302  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  51.63 
 
 		 505 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.82 
 
 		 513 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.03 
 
 		 485 aa  299  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  50.81 
 
 		 510 aa  298  7e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.49 
 
 		 562 aa  298  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 540 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4860  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.27 
 
 		 314 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  50.33 
 
 		 563 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.21 
 
 		 432 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 487 aa  295  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 584 aa  295  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 561 aa  295  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.54 
 
 		 452 aa  295  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 582 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  48.41 
 
 		 408 aa  294  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.49 
 
 		 501 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  47.56 
 
 		 495 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  47.56 
 
 		 471 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 		 587 aa  292  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.2 
 
 		 397 aa  292  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  48.39 
 
 		 362 aa  291  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 491 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  46.67 
 
 		 541 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 643 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.74 
 
 		 373 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 611 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 615 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.49 
 
 		 447 aa  288  6e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 540 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 621 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 482 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.98 
 
 		 515 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.51 
 
 		 535 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  47.45 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  49.19 
 
 		 541 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.19 
 
 		 523 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  49.19 
 
 		 553 aa  285  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.6 
 
 		 387 aa  285  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0889  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.56 
 
 		 310 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  46.39 
 
 		 410 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0888  cell division ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein FtsY  47.33 
 
 		 303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  47.88 
 
 		 498 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  47.88 
 
 		 498 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  47.88 
 
 		 498 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  47.88 
 
 		 512 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  47.88 
 
 		 498 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  47.88 
 
 		 498 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.88 
 
 		 497 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  47.88 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  47.56 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  49.01 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>