More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0402 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0402  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 315 aa  617  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0316  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  91.72 
 
 		 315 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0375  signal recognition particle-docking protein FtsY  85.35 
 
 		 315 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0212  signal recognition particle-docking protein FtsY  83.49 
 
 		 316 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0517  signal recognition particle-docking protein FtsY  81.85 
 
 		 315 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0362  signal recognition particle-docking protein FtsY  81.21 
 
 		 315 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0207  signal recognition particle-docking protein FtsY  81.59 
 
 		 315 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0361  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.9 
 
 		 408 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.48 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.16 
 
 		 473 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.75 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2950  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.42 
 
 		 488 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260236  hitchhiker  0.00455351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2723  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.09 
 
 		 488 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3223  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.87 
 
 		 483 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0413  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.09 
 
 		 529 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.571496  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5338  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.41 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.870799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0925  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.03 
 
 		 494 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3091  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.58 
 
 		 520 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.694563 
 
 
-
 
NC_004310  BR1934  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.79 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1861  cell division protein FtsY  65.79 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229627  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3389  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.06 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.75 
 
 		 528 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4069  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.42 
 
 		 533 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.605645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0017  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.46 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.278591  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4196  cell division particle  62.83 
 
 		 454 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.701722  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1413  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.05 
 
 		 316 aa  368  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1181  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.81 
 
 		 506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0879214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2496  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.45 
 
 		 312 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.09 
 
 		 346 aa  336  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0632  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.21 
 
 		 410 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2725  hypothetical protein  59.57 
 
 		 499 aa  335  5e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1843  Signal recognition particle-docking protein FtsY  59.21 
 
 		 393 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.84 
 
 		 379 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0977518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2930  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.62 
 
 		 311 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1214  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.48 
 
 		 381 aa  328  7e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.48 
 
 		 386 aa  328  8e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2853  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.54 
 
 		 309 aa  323  3e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2732  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.29 
 
 		 308 aa  320  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0521  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.33 
 
 		 326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.948166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1400  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.13 
 
 		 308 aa  312  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.92 
 
 		 478 aa  301  8.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.86 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 		 477 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.15 
 
 		 514 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.82 
 
 		 561 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.15 
 
 		 497 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.15 
 
 		 510 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.15 
 
 		 494 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.15 
 
 		 513 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 432 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  52.15 
 
 		 505 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 373 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 452 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.38 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.41 
 
 		 485 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 540 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 		 487 aa  292  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  49.84 
 
 		 510 aa  289  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 491 aa  288  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.18 
 
 		 562 aa  288  8e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  47.71 
 
 		 471 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.51 
 
 		 584 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  48.01 
 
 		 495 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.18 
 
 		 582 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  48.23 
 
 		 362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.76 
 
 		 587 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  46.47 
 
 		 541 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.49 
 
 		 643 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  46.28 
 
 		 410 aa  286  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  48.85 
 
 		 355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4860  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  48.52 
 
 		 355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.56 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  47.9 
 
 		 563 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  46.73 
 
 		 408 aa  281  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0888  cell division ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein FtsY  47 
 
 		 303 aa  281  9e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.49 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  47.71 
 
 		 498 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  47.71 
 
 		 498 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  47.71 
 
 		 498 aa  280  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  47.71 
 
 		 512 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  47.71 
 
 		 491 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  47.71 
 
 		 491 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.08 
 
 		 482 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  47.71 
 
 		 491 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  47.06 
 
 		 511 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  47.71 
 
 		 498 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  47.71 
 
 		 497 aa  280  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  47.71 
 
 		 498 aa  280  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.71 
 
 		 497 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  47.71 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  47.71 
 
 		 497 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.68 
 
 		 615 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.07 
 
 		 475 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.68 
 
 		 611 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.98 
 
 		 329 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.68 
 
 		 621 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  49.01 
 
 		 553 aa  279  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>