More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3858 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  99 
 
 		 498 aa  885    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  97.99 
 
 		 497 aa  872    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  99 
 
 		 498 aa  885    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  82.41 
 
 		 491 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  98.8 
 
 		 498 aa  877    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  100 
 
 		 497 aa  978    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  82.61 
 
 		 491 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  82.61 
 
 		 491 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  99.4 
 
 		 497 aa  971    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  98.8 
 
 		 498 aa  875    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  82.41 
 
 		 491 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  94.53 
 
 		 512 aa  867    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  82.41 
 
 		 491 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  98.8 
 
 		 498 aa  875    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  81.01 
 
 		 511 aa  664    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  66.67 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.26 
 
 		 452 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.07 
 
 		 432 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  64.72 
 
 		 495 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.92 
 
 		 535 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  62.55 
 
 		 541 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.6 
 
 		 523 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.73 
 
 		 481 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.08 
 
 		 491 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.63 
 
 		 561 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.26 
 
 		 485 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.52 
 
 		 482 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.59 
 
 		 643 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  71.82 
 
 		 510 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  73.24 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.78 
 
 		 582 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  77.09 
 
 		 584 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.47 
 
 		 562 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  79.23 
 
 		 487 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.38 
 
 		 587 aa  488  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  77.02 
 
 		 611 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.15 
 
 		 540 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  77.02 
 
 		 621 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.01 
 
 		 540 aa  485  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.34 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  77.02 
 
 		 615 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  79.62 
 
 		 408 aa  488  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  78.27 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  77.5 
 
 		 407 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.38 
 
 		 447 aa  478  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  72.41 
 
 		 541 aa  472  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  57.03 
 
 		 410 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.33 
 
 		 494 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.85 
 
 		 497 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.2 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.94 
 
 		 501 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  51.28 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0056  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.29 
 
 		 354 aa  434  1e-120  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.377347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.77 
 
 		 514 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.85 
 
 		 513 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  62.96 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  60 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.06 
 
 		 413 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.02 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.31 
 
 		 478 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.97 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.43 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  66.45 
 
 		 451 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  66.78 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.61 
 
 		 475 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  65.16 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  64.17 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.37 
 
 		 397 aa  395  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.5 
 
 		 375 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.21 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.5 
 
 		 329 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  61.44 
 
 		 671 aa  359  7e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  58.7 
 
 		 324 aa  355  7.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2108  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.7 
 
 		 324 aa  355  8.999999999999999e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.9 
 
 		 347 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1544  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.87 
 
 		 391 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  54.82 
 
 		 350 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.72 
 
 		 335 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.04 
 
 		 376 aa  335  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.37 
 
 		 351 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.13 
 
 		 326 aa  325  8.000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.34 
 
 		 340 aa  325  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.07 
 
 		 342 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2753  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.38 
 
 		 316 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2373  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.38 
 
 		 343 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119612  hitchhiker  0.000783963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.28 
 
 		 311 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2723  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.1 
 
 		 488 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2738  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.28 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3616  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.97 
 
 		 461 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0413  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.69 
 
 		 529 aa  317  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.571496  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0281  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 340 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.99 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.78 
 
 		 319 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1181  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.24 
 
 		 506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0879214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.66 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3223  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.2 
 
 		 483 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 		 382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.1 
 
 		 493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.82 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  49.34 
 
 		 408 aa  311  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>