More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0334 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
382 aa  759    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0281  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.82 
 
 
340 aa  579  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0241  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.38 
 
 
394 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0386  putative cell division protein  83.54 
 
 
328 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.919397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0268  signal recognition particle-docking protein FtsY  81.46 
 
 
398 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6139  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.88 
 
 
388 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4140  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.27 
 
 
385 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.27 
 
 
380 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0466  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.82 
 
 
433 aa  494  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0578  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.58 
 
 
386 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2820  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.03 
 
 
388 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632562  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0308  signal recognition particle-docking protein FtsY  80.07 
 
 
392 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441566  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2727  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.67 
 
 
386 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2195  signal recognition particle-docking protein FtsY  78.88 
 
 
327 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2869  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.93 
 
 
386 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2809  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.18 
 
 
388 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3127  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.21 
 
 
327 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0746  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.21 
 
 
476 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0576  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.21 
 
 
476 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0561  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.53 
 
 
439 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0316268  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0096  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.21 
 
 
439 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.838826  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2922  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.21 
 
 
439 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1493  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.21 
 
 
439 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.51 
 
 
335 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4374  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.79 
 
 
302 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1799  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.8 
 
 
406 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal  0.394868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3616  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.11 
 
 
461 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2843  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.46 
 
 
382 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3874  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.56 
 
 
305 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3520  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.46 
 
 
382 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2738  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.15 
 
 
328 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.58 
 
 
376 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1278  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.38 
 
 
379 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3718  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.42 
 
 
361 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4761  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.11 
 
 
373 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235875  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0891  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.03 
 
 
390 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3222  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.19 
 
 
350 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1672  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.13 
 
 
364 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3504  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.69 
 
 
346 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.75 
 
 
510 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.88 
 
 
481 aa  329  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 
494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  51.16 
 
 
362 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.14 
 
 
497 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.94 
 
 
373 aa  323  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.14 
 
 
514 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  49.84 
 
 
495 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  49.84 
 
 
471 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.72 
 
 
452 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.92 
 
 
405 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  48.56 
 
 
505 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.47 
 
 
501 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 
485 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.97 
 
 
432 aa  316  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.62 
 
 
513 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.43 
 
 
535 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1544  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.56 
 
 
391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  51.77 
 
 
541 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  51.77 
 
 
553 aa  308  8e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.77 
 
 
523 aa  308  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.51 
 
 
397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.7 
 
 
453 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.82 
 
 
475 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1055  cell division protein  51.51 
 
 
397 aa  305  9.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.65 
 
 
347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  47.6 
 
 
491 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  48.7 
 
 
541 aa  302  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  50.33 
 
 
491 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  50.33 
 
 
491 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.64 
 
 
329 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  47.6 
 
 
491 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  51.98 
 
 
671 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.74 
 
 
397 aa  301  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.05 
 
 
451 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.59 
 
 
375 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  49.86 
 
 
451 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.05 
 
 
515 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  53.97 
 
 
447 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.3 
 
 
447 aa  300  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  49.52 
 
 
498 aa  299  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  49.52 
 
 
498 aa  299  5e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  49.52 
 
 
512 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  49.52 
 
 
498 aa  299  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  49.52 
 
 
498 aa  299  5e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.28 
 
 
389 aa  299  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  49.52 
 
 
498 aa  299  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  49.2 
 
 
497 aa  299  7e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.82 
 
 
482 aa  299  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.52 
 
 
497 aa  298  9e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  47.31 
 
 
491 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  49.52 
 
 
497 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  49.01 
 
 
511 aa  297  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  51.63 
 
 
510 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 
561 aa  296  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0056  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.25 
 
 
354 aa  296  3e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.377347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.63 
 
 
562 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.68 
 
 
311 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.48 
 
 
584 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  50.5 
 
 
563 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.48 
 
 
540 aa  292  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>