More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0427 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 513 aa  1007    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  86.6 
 
 		 505 aa  825    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.23 
 
 		 510 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.73 
 
 		 515 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.85 
 
 		 494 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.85 
 
 		 497 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  82.07 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.21 
 
 		 451 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  86.93 
 
 		 447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  87.25 
 
 		 451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  86.93 
 
 		 475 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.9 
 
 		 481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.28 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  67.08 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.55 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.6 
 
 		 485 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  48.21 
 
 		 471 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.77 
 
 		 432 aa  432  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.18 
 
 		 452 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  62 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.43 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.09 
 
 		 375 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  57.11 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.8 
 
 		 491 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  50.29 
 
 		 510 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.42 
 
 		 405 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  47.32 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.61 
 
 		 387 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.38 
 
 		 535 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  67.52 
 
 		 563 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  65.4 
 
 		 541 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  50.87 
 
 		 497 aa  415  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.06 
 
 		 523 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  66.06 
 
 		 553 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  50.48 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  49.72 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.32 
 
 		 643 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  49.72 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  68.85 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  67.19 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.88 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.28 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.8 
 
 		 482 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.41 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.83 
 
 		 582 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.14 
 
 		 562 aa  412  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.29 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.88 
 
 		 611 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  68.52 
 
 		 498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  67.86 
 
 		 491 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  68.18 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  67.86 
 
 		 491 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  68.52 
 
 		 498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  68.52 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.14 
 
 		 584 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  66.98 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  68.52 
 
 		 498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.88 
 
 		 615 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.21 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.88 
 
 		 621 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  67.86 
 
 		 491 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.42 
 
 		 487 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.88 
 
 		 540 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.36 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.35 
 
 		 587 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  67.53 
 
 		 491 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.08 
 
 		 478 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.14 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  67.54 
 
 		 671 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  65.9 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  66.23 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  66.23 
 
 		 410 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.08 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0056  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.73 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.377347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.21 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  61.44 
 
 		 324 aa  363  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2108  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.11 
 
 		 324 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.2 
 
 		 311 aa  361  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2305  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.18 
 
 		 315 aa  356  5e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1544  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.57 
 
 		 391 aa  355  1e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  56 
 
 		 350 aa  349  5e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.45 
 
 		 397 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.37 
 
 		 351 aa  345  8e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1055  cell division protein  49.45 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.02 
 
 		 376 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2738  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.8 
 
 		 328 aa  345  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.95 
 
 		 342 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2373  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.7 
 
 		 343 aa  341  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119612  hitchhiker  0.000783963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.62 
 
 		 340 aa  339  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2753  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.53 
 
 		 316 aa  339  7e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.72 
 
 		 326 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.59 
 
 		 335 aa  334  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4140  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.57 
 
 		 385 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1181  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.49 
 
 		 506 aa  326  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0879214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0578  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.58 
 
 		 386 aa  326  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0308  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.41 
 
 		 392 aa  325  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0466  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.25 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6139  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.93 
 
 		 388 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0746  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.26 
 
 		 476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0576  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.26 
 
 		 476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>