More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0219 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.32 
 
 		 561 aa  709    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 540 aa  1044    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.35 
 
 		 643 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  77.08 
 
 		 491 aa  748    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  68.66 
 
 		 510 aa  629  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.17 
 
 		 482 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.84 
 
 		 562 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.64 
 
 		 540 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  65.53 
 
 		 563 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.8 
 
 		 587 aa  591  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  86.42 
 
 		 582 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  86.11 
 
 		 584 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  86.48 
 
 		 611 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  86.48 
 
 		 615 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  86.48 
 
 		 621 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.54 
 
 		 452 aa  518  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.54 
 
 		 453 aa  513  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.85 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.97 
 
 		 485 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  74.51 
 
 		 481 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  75.88 
 
 		 495 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  75.56 
 
 		 471 aa  497  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  56.9 
 
 		 498 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.9 
 
 		 497 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  56.9 
 
 		 498 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  56.38 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  76.01 
 
 		 498 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  78.14 
 
 		 491 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  77.81 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  76.01 
 
 		 498 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  76.01 
 
 		 498 aa  491  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  78.14 
 
 		 491 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  57.14 
 
 		 497 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  57.14 
 
 		 497 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  77.81 
 
 		 491 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  78.14 
 
 		 491 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  77.81 
 
 		 491 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.51 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  70.62 
 
 		 541 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  76.53 
 
 		 553 aa  472  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  76.85 
 
 		 541 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  73.63 
 
 		 408 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.99 
 
 		 387 aa  458  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  72.99 
 
 		 407 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  73.8 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.04 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.02 
 
 		 447 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.67 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.15 
 
 		 510 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  65.94 
 
 		 505 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.42 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.78 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.78 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.24 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.44 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.87 
 
 		 373 aa  415  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.17 
 
 		 375 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.72 
 
 		 477 aa  415  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0056  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.27 
 
 		 354 aa  415  1e-114  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.377347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  65.57 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.55 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.08 
 
 		 451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.77 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  64.54 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  65.15 
 
 		 447 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.99 
 
 		 475 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  60.47 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  60.18 
 
 		 355 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.7 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.69 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  60.66 
 
 		 671 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.73 
 
 		 347 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1544  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.99 
 
 		 391 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  60.26 
 
 		 324 aa  352  1e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2108  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.26 
 
 		 324 aa  351  2e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.19 
 
 		 437 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.55 
 
 		 473 aa  346  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.15 
 
 		 351 aa  346  6e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.97 
 
 		 342 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  56.13 
 
 		 350 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.85 
 
 		 340 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.7 
 
 		 376 aa  336  5.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.49 
 
 		 335 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.95 
 
 		 326 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.52 
 
 		 311 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2753  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.39 
 
 		 316 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2373  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.39 
 
 		 343 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119612  hitchhiker  0.000783963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0361  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.53 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0413  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.85 
 
 		 529 aa  329  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.571496  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2738  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.02 
 
 		 328 aa  329  9e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1181  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.91 
 
 		 506 aa  327  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0879214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5338  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 466 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.870799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0362  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.79 
 
 		 315 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2950  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 488 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260236  hitchhiker  0.00455351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2723  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 488 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0017  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.63 
 
 		 387 aa  323  4e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.278591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2305  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.31 
 
 		 315 aa  323  4e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0517  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.79 
 
 		 315 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.97 
 
 		 493 aa  323  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3223  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.25 
 
 		 483 aa  323  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>