More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1176 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 351 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  81.77 
 
 		 350 aa  568  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.51 
 
 		 340 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.3 
 
 		 342 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3317  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.61 
 
 		 381 aa  448  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0964  signal recognition particle-docking protein FtsY  74.01 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0490186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3297  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.15 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2354  cell division membrane protein  65.12 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000763762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.17 
 
 		 326 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  55.85 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  57.19 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.58 
 
 		 381 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.76 
 
 		 373 aa  355  6.999999999999999e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.46 
 
 		 510 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.33 
 
 		 494 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.33 
 
 		 497 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.72 
 
 		 377 aa  351  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.8 
 
 		 310 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.24 
 
 		 514 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  56.69 
 
 		 505 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.31 
 
 		 319 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.74 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  55.52 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.74 
 
 		 485 aa  345  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.09 
 
 		 320 aa  345  6e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.89 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.42 
 
 		 451 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.28 
 
 		 513 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.48 
 
 		 309 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  53.61 
 
 		 362 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.27 
 
 		 481 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.92 
 
 		 453 aa  340  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.69 
 
 		 501 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.95 
 
 		 318 aa  338  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.81 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.98 
 
 		 475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.11 
 
 		 320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.88 
 
 		 482 aa  335  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.28 
 
 		 562 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.38 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.89 
 
 		 397 aa  334  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  55.73 
 
 		 495 aa  334  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  54.97 
 
 		 471 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  55.28 
 
 		 541 aa  334  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  58.9 
 
 		 451 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.45 
 
 		 432 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.28 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.23 
 
 		 611 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.9 
 
 		 584 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0962  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.48 
 
 		 311 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.23 
 
 		 615 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.23 
 
 		 621 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.23 
 
 		 540 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.63 
 
 		 375 aa  331  9e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.17 
 
 		 452 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  55.28 
 
 		 510 aa  331  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.97 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.07 
 
 		 487 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.15 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.01 
 
 		 491 aa  329  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.28 
 
 		 582 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.62 
 
 		 302 aa  329  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.01 
 
 		 335 aa  329  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  54.86 
 
 		 408 aa  329  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  58.61 
 
 		 447 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.15 
 
 		 540 aa  328  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 320 aa  328  8e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0708  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.96 
 
 		 469 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.64 
 
 		 523 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  57.64 
 
 		 553 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0707  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.96 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  57.64 
 
 		 541 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.63 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.22 
 
 		 477 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.62 
 
 		 302 aa  326  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.77 
 
 		 320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.15 
 
 		 329 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.87 
 
 		 389 aa  324  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.1 
 
 		 587 aa  324  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0646  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.21 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.124124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.63 
 
 		 320 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.25 
 
 		 643 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  52.17 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.52 
 
 		 478 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.15 
 
 		 329 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  51.64 
 
 		 317 aa  323  4e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.05 
 
 		 320 aa  323  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.15 
 
 		 329 aa  322  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.59 
 
 		 561 aa  322  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.32 
 
 		 535 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  55.99 
 
 		 407 aa  322  7e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1976  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.46 
 
 		 328 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 317 aa  322  8e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.63 
 
 		 329 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.92 
 
 		 387 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  54.82 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  54.23 
 
 		 410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2373  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.66 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119612  hitchhiker  0.000783963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  54.23 
 
 		 511 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  51.9 
 
 		 563 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>