More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4860 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4860  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 314 aa  626  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.19 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.5 
 
 		 473 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1413  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.45 
 
 		 316 aa  322  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2853  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.14 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2723  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.27 
 
 		 488 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2950  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.94 
 
 		 488 aa  319  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260236  hitchhiker  0.00455351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.75 
 
 		 528 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5338  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.77 
 
 		 466 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.870799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4069  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.23 
 
 		 533 aa  318  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.605645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0925  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.02 
 
 		 494 aa  318  5e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.76 
 
 		 493 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3389  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.23 
 
 		 500 aa  315  8e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0517  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.78 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3091  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.59 
 
 		 520 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.694563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0207  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.27 
 
 		 315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0375  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.94 
 
 		 315 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0017  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.96 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.278591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0362  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.78 
 
 		 315 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1934  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.56 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1861  cell division protein FtsY  52.56 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229627  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4196  cell division particle  53.21 
 
 		 454 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.701722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1181  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 		 506 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0879214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0361  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.31 
 
 		 408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0413  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.92 
 
 		 529 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.571496  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0316  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  48.9 
 
 		 315 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3223  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.6 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0402  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 		 315 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2496  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0212  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 316 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1214  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.9 
 
 		 381 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0521  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.65 
 
 		 326 aa  292  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.948166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.56 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0632  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.12 
 
 		 410 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2930  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 311 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1843  Signal recognition particle-docking protein FtsY  54.12 
 
 		 393 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.12 
 
 		 379 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0977518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2732  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 308 aa  279  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1400  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324422  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.33 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2725  hypothetical protein  51.08 
 
 		 499 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.03 
 
 		 452 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.52 
 
 		 381 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  44.38 
 
 		 471 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  43.75 
 
 		 495 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.11 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  43.4 
 
 		 541 aa  258  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.77 
 
 		 481 aa  254  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.49 
 
 		 485 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.5 
 
 		 453 aa  253  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  45.69 
 
 		 563 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.4 
 
 		 523 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  45.4 
 
 		 541 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  45.4 
 
 		 553 aa  250  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.22 
 
 		 561 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.23 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.77 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.22 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  42.9 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1768  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.52 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00021093  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.51 
 
 		 405 aa  247  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.98 
 
 		 494 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.39 
 
 		 514 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.69 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.98 
 
 		 510 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.4 
 
 		 535 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0560  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.6 
 
 		 506 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000445569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.3 
 
 		 501 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4170  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.77 
 
 		 313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  43.34 
 
 		 408 aa  245  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.98 
 
 		 497 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.09 
 
 		 482 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.77 
 
 		 615 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.77 
 
 		 611 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.99 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.77 
 
 		 621 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.34 
 
 		 540 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.13 
 
 		 562 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.65 
 
 		 491 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.77 
 
 		 540 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.1 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.13 
 
 		 584 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.66 
 
 		 643 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.57 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.16 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.09 
 
 		 587 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.81 
 
 		 483 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.49 
 
 		 477 aa  240  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.79 
 
 		 389 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.09 
 
 		 413 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  44.13 
 
 		 511 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.95 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.46 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.34 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  42.04 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  43.13 
 
 		 510 aa  239  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  43.65 
 
 		 407 aa  239  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.94 
 
 		 329 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.87 
 
 		 478 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.06 
 
 		 375 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>