More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1843 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1843  Signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 393 aa  771    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  98.69 
 
 		 379 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0977518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0632  signal recognition particle-docking protein FtsY  82.54 
 
 		 410 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  74.94 
 
 		 386 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  73.18 
 
 		 346 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1214  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.18 
 
 		 381 aa  514  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2725  hypothetical protein  87.68 
 
 		 499 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0361  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.13 
 
 		 408 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.9 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.93 
 
 		 473 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1181  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.69 
 
 		 506 aa  352  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0879214  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1934  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.59 
 
 		 463 aa  349  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1861  cell division protein FtsY  61.59 
 
 		 465 aa  349  6e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5338  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.82 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.870799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.04 
 
 		 493 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2723  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.04 
 
 		 488 aa  346  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0925  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.51 
 
 		 494 aa  346  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2950  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.04 
 
 		 488 aa  345  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260236  hitchhiker  0.00455351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0375  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.5 
 
 		 315 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0517  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.63 
 
 		 315 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0362  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.99 
 
 		 315 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0316  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  58.99 
 
 		 315 aa  338  7e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0207  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.27 
 
 		 315 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3223  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.9 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0212  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.91 
 
 		 316 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0402  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.99 
 
 		 315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0017  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.25 
 
 		 387 aa  335  7.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.278591  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0413  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.27 
 
 		 529 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.571496  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3389  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.12 
 
 		 500 aa  332  8e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.97 
 
 		 528 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4069  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.61 
 
 		 533 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.605645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3091  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.25 
 
 		 520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.694563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4196  cell division particle  59.23 
 
 		 454 aa  325  8.000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.701722  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2496  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.93 
 
 		 312 aa  325  9e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1413  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.7 
 
 		 316 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0521  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.62 
 
 		 326 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.948166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1400  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.93 
 
 		 308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2930  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.54 
 
 		 311 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.4 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2853  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.14 
 
 		 309 aa  300  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.64 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2732  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.68 
 
 		 308 aa  298  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  48.92 
 
 		 471 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  48.61 
 
 		 495 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.99 
 
 		 478 aa  294  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.09 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.18 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.79 
 
 		 561 aa  292  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 540 aa  292  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.48 
 
 		 491 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.58 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.89 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.88 
 
 		 481 aa  290  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.23 
 
 		 562 aa  290  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  47.35 
 
 		 510 aa  289  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.53 
 
 		 611 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 482 aa  288  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 540 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  50.64 
 
 		 563 aa  288  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  48.42 
 
 		 350 aa  288  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.53 
 
 		 615 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.85 
 
 		 621 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.56 
 
 		 510 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.09 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  47.85 
 
 		 491 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  47.85 
 
 		 491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.15 
 
 		 584 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.73 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 447 aa  285  7e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.15 
 
 		 416 aa  285  8e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.15 
 
 		 416 aa  285  8e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.15 
 
 		 582 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  47.98 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  47.55 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  47.09 
 
 		 512 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  47.24 
 
 		 498 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  47.24 
 
 		 498 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.83 
 
 		 523 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0889  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.19 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  47.24 
 
 		 498 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  47.24 
 
 		 498 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  47.24 
 
 		 498 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.31 
 
 		 587 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  47.24 
 
 		 491 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.24 
 
 		 497 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.88 
 
 		 643 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.76 
 
 		 514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.2 
 
 		 487 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  47.81 
 
 		 511 aa  282  7.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.65 
 
 		 351 aa  282  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  47.73 
 
 		 541 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  47.5 
 
 		 497 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  38.93 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.88 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  47.73 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  48.18 
 
 		 505 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.18 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  47.5 
 
 		 497 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.65 
 
 		 375 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.19 
 
 		 309 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>