218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2243 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  100 
 
 		 106 aa  219  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  79.25 
 
 		 106 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  77.36 
 
 		 106 aa  177  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  79.25 
 
 		 106 aa  176  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  70.75 
 
 		 106 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  67.62 
 
 		 106 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  66.67 
 
 		 106 aa  153  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  67.62 
 
 		 106 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  66.98 
 
 		 107 aa  151  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  64.76 
 
 		 106 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  65.71 
 
 		 106 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  66.98 
 
 		 107 aa  151  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  65.09 
 
 		 106 aa  150  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  64.76 
 
 		 106 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  66.04 
 
 		 107 aa  149  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  65.71 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  66.98 
 
 		 106 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  65.71 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  66.04 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  61.9 
 
 		 106 aa  143  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  61.32 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  64.15 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  63.21 
 
 		 106 aa  140  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  65.09 
 
 		 106 aa  140  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  61.32 
 
 		 106 aa  136  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  61.32 
 
 		 106 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  56.6 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  58.49 
 
 		 107 aa  126  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  57.55 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  58.49 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  58.49 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  57.55 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  57.55 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  55.66 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  116  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  116  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  51.89 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  48.57 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  53.77 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  49.06 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  48.57 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  47.17 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  50 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  42.16 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  48.54 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  48.04 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  45.79 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  50.94 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  54.44 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  43.81 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  46.23 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  47.17 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  45.28 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  50.52 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  43.93 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  48.24 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  50 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  45.1 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  47.17 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  44.23 
 
 		 104 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  45.28 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  44.34 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  42.16 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  48.78 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  40 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  47.92 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  40.78 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  40.95 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  39.22 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  35 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  40.59 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  42.31 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  41.35 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  38.83 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  38.61 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  37.14 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  36.63 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16510  ferredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  35.64 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  37.38 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  36.27 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  41.58 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  38.46 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.91 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.38 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.64 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.77 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.77 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.77 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.64 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  37.5 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  39.77 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>