198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4857 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
528 aa  1093    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  57.62 
 
 
543 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  56.74 
 
 
545 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  56.55 
 
 
545 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  57.14 
 
 
545 aa  605  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  51.66 
 
 
585 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  50.34 
 
 
479 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  43.54 
 
 
467 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  43.02 
 
 
472 aa  354  2e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  34.99 
 
 
487 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  35.2 
 
 
481 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  45.74 
 
 
260 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.79 
 
 
386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  25.06 
 
 
376 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  31.15 
 
 
404 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  24.94 
 
 
393 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.67 
 
 
363 aa  88.2  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  23.74 
 
 
392 aa  87.4  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02891  hypothetical protein  52.17 
 
 
75 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.294183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.17 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.57 
 
 
196 aa  68.6  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.16 
 
 
590 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  27.7 
 
 
230 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  26.51 
 
 
230 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  26.13 
 
 
591 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  27.67 
 
 
598 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  25.97 
 
 
286 aa  64.3  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  27.42 
 
 
593 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  27.33 
 
 
598 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  27.33 
 
 
598 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  29.08 
 
 
196 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  27 
 
 
597 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  29.8 
 
 
176 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  29.8 
 
 
176 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  24.86 
 
 
234 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  27.09 
 
 
593 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  24.42 
 
 
286 aa  60.5  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  21.32 
 
 
359 aa  60.5  0.00000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2033  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  45.76 
 
 
93 aa  60.5  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000281796  hitchhiker  0.000016405 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  28.09 
 
 
175 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  27.42 
 
 
613 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  24.85 
 
 
203 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3047  helix-hairpin-helix motif protein  50 
 
 
116 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  28.19 
 
 
177 aa  58.5  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  23.17 
 
 
389 aa  57.8  0.0000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1562  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  44.12 
 
 
261 aa  57.4  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07770  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  56.6 
 
 
255 aa  57  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.734048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  37.84 
 
 
194 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3498  hypothetical protein  42.55 
 
 
101 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183909  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1025  helix-hairpin-helix motif protein  50 
 
 
103 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0837725  normal  0.434373 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  26.6 
 
 
601 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  26.6 
 
 
601 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  26.6 
 
 
601 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.33 
 
 
187 aa  55.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  26.6 
 
 
601 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  26.6 
 
 
601 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  26.6 
 
 
601 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  26.6 
 
 
601 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2010  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.27 
 
 
301 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1982  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  41.43 
 
 
274 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000014049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44.26 
 
 
181 aa  54.7  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  23.53 
 
 
556 aa  54.7  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  26.42 
 
 
183 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  43.42 
 
 
213 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  23.83 
 
 
294 aa  53.9  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0943  comEA protein  39.13 
 
 
262 aa  53.9  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12460  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  47.37 
 
 
285 aa  53.5  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44.26 
 
 
181 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  21.19 
 
 
300 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1737  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.43 
 
 
290 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2290  hypothetical protein  42.19 
 
 
92 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.670591  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1233  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  48.33 
 
 
171 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  50 
 
 
190 aa  52.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02781  hypothetical protein  54.76 
 
 
56 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2230  Soluble ligand binding domain protein  36.07 
 
 
180 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0322679  hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3848  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  58.33 
 
 
279 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2211  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  50 
 
 
320 aa  52  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  54 
 
 
224 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1668  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  45.9 
 
 
206 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.98 
 
 
227 aa  52  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0010  competence protein ComEA  44.83 
 
 
79 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0037  competence protein ComEA  44.83 
 
 
79 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0368973  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1008  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  47.54 
 
 
114 aa  51.6  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000463906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3469  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  58.33 
 
 
280 aa  51.6  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389617  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1508  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  39.29 
 
 
127 aa  51.6  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0011  competence protein ComEA  44.83 
 
 
79 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00025095  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  26.67 
 
 
176 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4318  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40 
 
 
216 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.82 
 
 
560 aa  50.8  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1635  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40.3 
 
 
228 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0773  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.89 
 
 
250 aa  50.8  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.466163  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2831  hypothetical protein  26.09 
 
 
180 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000246961  decreased coverage  0.0000127532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  23.43 
 
 
589 aa  50.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0934  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.47 
 
 
211 aa  50.4  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.800656  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  23.43 
 
 
589 aa  50.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1179  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.47 
 
 
247 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  26.22 
 
 
561 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  25.93 
 
 
600 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  23.53 
 
 
559 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3198  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.86 
 
 
102 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>