More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4147 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  100 
 
 
633 aa  1298    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  41.24 
 
 
603 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  40.9 
 
 
603 aa  445  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  39.33 
 
 
610 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  39.17 
 
 
610 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  39.26 
 
 
594 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  43.15 
 
 
638 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  39.5 
 
 
593 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  38.32 
 
 
597 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  38.22 
 
 
599 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  37.8 
 
 
593 aa  390  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2516  ABC transporter-related protein  37.81 
 
 
610 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  38.74 
 
 
607 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  43.98 
 
 
618 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  37.39 
 
 
610 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.11 
 
 
610 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  42.35 
 
 
613 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  38.11 
 
 
610 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.24 
 
 
617 aa  382  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  37.39 
 
 
610 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3836  ABC transporter related  36.88 
 
 
610 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  37.42 
 
 
622 aa  379  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  40.97 
 
 
613 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  43.29 
 
 
621 aa  379  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.94 
 
 
610 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  39.08 
 
 
582 aa  374  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  37.06 
 
 
610 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  36.51 
 
 
621 aa  375  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  36.67 
 
 
591 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  36.09 
 
 
610 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  36.35 
 
 
610 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04842  ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 
610 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  37.36 
 
 
613 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  41.98 
 
 
609 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  37.91 
 
 
609 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  41.77 
 
 
609 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  36.12 
 
 
618 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  36.9 
 
 
609 aa  368  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  37.94 
 
 
614 aa  369  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  36.72 
 
 
614 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1674  ABC transporter related  36.56 
 
 
610 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  36.71 
 
 
609 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  37.48 
 
 
612 aa  369  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1307  ABC transporter related  37.33 
 
 
611 aa  369  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.556896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  37.19 
 
 
599 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  35.84 
 
 
610 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  43.97 
 
 
646 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  43.3 
 
 
646 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  43.97 
 
 
618 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1494  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.01 
 
 
630 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.283216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  41.15 
 
 
609 aa  369  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  36.59 
 
 
589 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  37.89 
 
 
622 aa  369  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22440  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  36 
 
 
610 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  37.79 
 
 
630 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0674  hypothetical protein  37.25 
 
 
581 aa  365  1e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  41.36 
 
 
609 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 
616 aa  365  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  36.47 
 
 
609 aa  364  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  41.07 
 
 
612 aa  365  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  37.62 
 
 
611 aa  363  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  35.69 
 
 
618 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  40.44 
 
 
619 aa  362  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.23 
 
 
619 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  36.3 
 
 
609 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  42.68 
 
 
621 aa  362  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3611  ABC transporter related  42.07 
 
 
626 aa  360  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  37.21 
 
 
663 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  37.56 
 
 
603 aa  359  7e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  34.88 
 
 
619 aa  359  9e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1235  ABC transporter related  37.23 
 
 
610 aa  358  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0197069  normal  0.341484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2721  ABC transporter related  41.38 
 
 
615 aa  359  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  37.1 
 
 
609 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  37.04 
 
 
636 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1740  ABC transporter related  36.27 
 
 
609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0539083  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
706 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  42.62 
 
 
624 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  38.32 
 
 
616 aa  357  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  40.96 
 
 
618 aa  356  6.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  35.21 
 
 
587 aa  356  7.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  34.68 
 
 
587 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2941  ABC transporter related  35.97 
 
 
609 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.417973  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2801  ABC transporter related  35.97 
 
 
609 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0386861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  39.39 
 
 
609 aa  355  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.4 
 
 
619 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1556  ABC transporter related  35.97 
 
 
609 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00693987  normal  0.0222029 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  40.08 
 
 
617 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.67 
 
 
621 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  35.1 
 
 
582 aa  352  1e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  37.04 
 
 
637 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  34.25 
 
 
598 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  37.04 
 
 
637 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  35.68 
 
 
609 aa  352  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  37.04 
 
 
637 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  34.12 
 
 
598 aa  351  3e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 
608 aa  351  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  35.11 
 
 
587 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  36.62 
 
 
609 aa  351  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  37.15 
 
 
588 aa  350  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_002978  WD0616  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  38.98 
 
 
591 aa  350  4e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.146496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>