221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0089 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
543 aa  1058    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2353  hypothetical protein  68.16 
 
 
541 aa  698    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2186  Na+/H+-exchanging protein  60.93 
 
 
545 aa  557  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.601594 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0270  sodium/hydrogen exchanger  41.22 
 
 
400 aa  252  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  37.16 
 
 
394 aa  233  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3197  sodium/hydrogen exchanger  37.93 
 
 
391 aa  228  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000344959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0193  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  37.23 
 
 
396 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1529  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
503 aa  191  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3111  sodium/hydrogen exchanger  35.4 
 
 
390 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000824463  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40732  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  29.14 
 
 
391 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00131155 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30420  predicted protein  28.53 
 
 
328 aa  88.2  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726911  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  28.41 
 
 
617 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 
608 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  28.29 
 
 
601 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 
601 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 
601 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  24.48 
 
 
760 aa  72  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 
602 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  24.37 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  24.11 
 
 
612 aa  70.1  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 
607 aa  70.1  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  26.73 
 
 
611 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0895  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 
420 aa  67  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  24.12 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  26.49 
 
 
611 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1574  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 
417 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810596 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  22.17 
 
 
498 aa  64.3  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  25.59 
 
 
637 aa  60.8  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  24.51 
 
 
611 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  23.36 
 
 
598 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  22.03 
 
 
596 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  21.98 
 
 
597 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  23.86 
 
 
651 aa  58.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  24.85 
 
 
617 aa  57  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 
619 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.08 
 
 
138 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  21.08 
 
 
597 aa  55.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.41 
 
 
477 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  22.16 
 
 
596 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.16 
 
 
596 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  29.79 
 
 
147 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  22.69 
 
 
608 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  23.8 
 
 
629 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.16 
 
 
596 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.16 
 
 
596 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  30.82 
 
 
153 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  29.58 
 
 
149 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  22.18 
 
 
764 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  22.65 
 
 
597 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  25.55 
 
 
389 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  28.5 
 
 
375 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  21.96 
 
 
596 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  23.75 
 
 
622 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 
397 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.16 
 
 
596 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  23.97 
 
 
763 aa  52  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  28.67 
 
 
150 aa  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  21.65 
 
 
597 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.63 
 
 
386 aa  52  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  30.41 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  30.41 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  30.41 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  30.41 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  30.41 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  30.41 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  21.6 
 
 
597 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  25.77 
 
 
538 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  19.69 
 
 
478 aa  50.8  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 
144 aa  50.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  29.12 
 
 
375 aa  50.8  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  28.57 
 
 
136 aa  50.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  24.55 
 
 
689 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  22.11 
 
 
596 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 
151 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  24.47 
 
 
412 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  25 
 
 
141 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.81 
 
 
145 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.51 
 
 
149 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.71 
 
 
162 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  24.24 
 
 
639 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  26.12 
 
 
144 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  32.05 
 
 
153 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  29.69 
 
 
617 aa  48.5  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  22.98 
 
 
641 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  38.75 
 
 
141 aa  48.5  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  26.09 
 
 
295 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  26.12 
 
 
144 aa  48.9  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  27.82 
 
 
138 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
172 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  29.1 
 
 
277 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 
145 aa  47.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  23.98 
 
 
599 aa  47.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  46.3 
 
 
150 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 
161 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  26.81 
 
 
145 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.83 
 
 
669 aa  47.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.43 
 
 
164 aa  47.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  25.79 
 
 
387 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  25.85 
 
 
166 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>