More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2354 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.28 
 
 
782 aa  814    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.8 
 
 
762 aa  788    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  52.77 
 
 
778 aa  826    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  50.84 
 
 
777 aa  810    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
771 aa  1582    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.13 
 
 
795 aa  669    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  50.64 
 
 
772 aa  790    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  50.97 
 
 
790 aa  827    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  52.65 
 
 
778 aa  823    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.12 
 
 
755 aa  620  1e-176  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.46 
 
 
760 aa  615  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  42.01 
 
 
805 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.8 
 
 
756 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.48 
 
 
783 aa  589  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.29 
 
 
773 aa  575  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  38.96 
 
 
788 aa  572  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.15 
 
 
760 aa  551  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  37.91 
 
 
811 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.71 
 
 
792 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.98 
 
 
807 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.95 
 
 
785 aa  539  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  37.23 
 
 
817 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  39.3 
 
 
808 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.22 
 
 
791 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.97 
 
 
771 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.21 
 
 
778 aa  522  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  37.42 
 
 
802 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.93 
 
 
784 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  36.58 
 
 
1037 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.21 
 
 
806 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.6 
 
 
798 aa  500  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.45 
 
 
769 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.75 
 
 
803 aa  499  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.05 
 
 
768 aa  495  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.69 
 
 
807 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.16 
 
 
809 aa  495  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.63 
 
 
760 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  35.09 
 
 
789 aa  485  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.21 
 
 
754 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.63 
 
 
790 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.62 
 
 
760 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.83 
 
 
811 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  34.92 
 
 
721 aa  467  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.34 
 
 
902 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  34.77 
 
 
743 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.16 
 
 
751 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  34.06 
 
 
743 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.99 
 
 
757 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.68 
 
 
813 aa  450  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.61 
 
 
751 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.86 
 
 
799 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.77 
 
 
804 aa  448  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  35.34 
 
 
737 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 
772 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  34.64 
 
 
750 aa  443  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  35.31 
 
 
738 aa  446  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 
766 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  36.06 
 
 
765 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.87 
 
 
766 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  33.85 
 
 
753 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  33.21 
 
 
765 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  35.97 
 
 
739 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  33.17 
 
 
859 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  34.12 
 
 
764 aa  426  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.69 
 
 
769 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.38 
 
 
769 aa  426  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.64 
 
 
762 aa  423  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  33.87 
 
 
793 aa  425  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  33.73 
 
 
755 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  33.03 
 
 
740 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  33.59 
 
 
755 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  33.73 
 
 
755 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  33.73 
 
 
755 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  34.42 
 
 
759 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.83 
 
 
801 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  33.16 
 
 
763 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  36.46 
 
 
759 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  33.73 
 
 
765 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.67 
 
 
774 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.36 
 
 
738 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.2 
 
 
702 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.95 
 
 
765 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
752 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  34.15 
 
 
743 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  32.95 
 
 
765 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
751 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  32.95 
 
 
765 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  33.33 
 
 
772 aa  412  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  32.82 
 
 
765 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  33.02 
 
 
727 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34 
 
 
759 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  32.95 
 
 
765 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  32.82 
 
 
765 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  32.82 
 
 
765 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  32.8 
 
 
727 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  32.82 
 
 
765 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  32.82 
 
 
765 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  31.93 
 
 
763 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  32.02 
 
 
763 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  32.78 
 
 
764 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>