66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0390 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0390  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 331 aa  671    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000824452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2394  radical SAM domain-containing protein  44.68 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0924  Radical SAM domain protein  37.87 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3375  radical SAM family protein  27.56 
 
 		 640 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0891  hypothetical protein  28.26 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1384  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  hitchhiker  0.00082809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3357  radical SAM family protein  22.71 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158709  normal  0.0575022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2162  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.211612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2181  hypothetical protein  24.73 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0928383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3720  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0048621  normal  0.524582 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 496 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  24.28 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  23.35 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0419  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  22.65 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.74 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1611  Radical SAM domain protein  22.88 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  23.05 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 401 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  22.94 
 
 		 393 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2695  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  27.91 
 
 		 351 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 		 332 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  17.87 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.67 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 404 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  33.01 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0454  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.3 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1409  hypothetical protein  23.93 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.287202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 429 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  40 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.44 
 
 		 379 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 469 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  30.85 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  25 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4523  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  36.62 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  31.37 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 465 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 442 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  33.33 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 442 aa  43.1  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  26.9 
 
 		 510 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  29.79 
 
 		 361 aa  42.7  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  31.34 
 
 		 310 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  21.83 
 
 		 367 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.47 
 
 		 414 aa  42.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  30.68 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  32.39 
 
 		 311 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>