58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4136 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  100 
 
 		 308 aa  600  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  40.27 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  34.2 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  31.99 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  34.22 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  32.08 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  32.2 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  32.97 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  31.5 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  31.03 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  31.54 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  29.7 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  28.62 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  33.68 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 379 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  29.89 
 
 		 272 aa  95.9  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  29.89 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  34.39 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  30.37 
 
 		 239 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  29.68 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  28.37 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  31.51 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  29.37 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  29.1 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  33.88 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  29.74 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  32.01 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  29.91 
 
 		 750 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  32.42 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  28 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  34.78 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  32.34 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  30.69 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  32 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  26.94 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  28.24 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  29.03 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  30.46 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  28.93 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  28.73 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  31.39 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  27.32 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  37.04 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  29.26 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  29.41 
 
 		 260 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  23.91 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  30.71 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  30.71 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  30.71 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2844  integral membrane protein  31.34 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  29.67 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  33.61 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  25.87 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  27.68 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  27.46 
 
 		 284 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  25.86 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>