More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3820 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3820  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  795    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  48.26 
 
 
482 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  46.9 
 
 
472 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  48.13 
 
 
443 aa  290  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  45.76 
 
 
430 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  44.73 
 
 
439 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2900  major facilitator transporter  45.18 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  42.42 
 
 
457 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  42.42 
 
 
457 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  42.42 
 
 
457 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  42.33 
 
 
439 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.09 
 
 
437 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  40.62 
 
 
439 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  42.33 
 
 
439 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.2 
 
 
439 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.33 
 
 
439 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.33 
 
 
439 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.2 
 
 
439 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.37 
 
 
437 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 
446 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  41.28 
 
 
456 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  40.41 
 
 
441 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  39.51 
 
 
458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  40.68 
 
 
432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  39.72 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.83 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  40.68 
 
 
432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  40.68 
 
 
432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  40.82 
 
 
461 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  40.82 
 
 
461 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  40.82 
 
 
461 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  39.54 
 
 
447 aa  233  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  41 
 
 
443 aa  232  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  39.94 
 
 
482 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  42.3 
 
 
434 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  35.94 
 
 
441 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.76 
 
 
437 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 
440 aa  229  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  39.63 
 
 
437 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 
437 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  41 
 
 
439 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  39.88 
 
 
436 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  40 
 
 
447 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  38.35 
 
 
446 aa  226  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  39.7 
 
 
477 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
442 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  36.75 
 
 
450 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  36.96 
 
 
450 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 
461 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 
477 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  41.14 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  39 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  41.14 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  39.77 
 
 
459 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  39.77 
 
 
460 aa  220  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  41.21 
 
 
433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  49.77 
 
 
524 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  37.89 
 
 
458 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 
431 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  39.04 
 
 
450 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  38.84 
 
 
452 aa  219  7e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  48.92 
 
 
469 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  39.22 
 
 
468 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  40.49 
 
 
444 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  40.49 
 
 
444 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  40.49 
 
 
444 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  40.49 
 
 
444 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  40.49 
 
 
444 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  40.49 
 
 
444 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  40.49 
 
 
444 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  48.28 
 
 
436 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  49.35 
 
 
436 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  38.68 
 
 
471 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  49.35 
 
 
436 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  39.63 
 
 
474 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  39.83 
 
 
484 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  49.35 
 
 
436 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  36.99 
 
 
446 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  49.35 
 
 
436 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  49.78 
 
 
468 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  35.88 
 
 
444 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  37.96 
 
 
441 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  39.33 
 
 
481 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  37.6 
 
 
470 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 
465 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  38.99 
 
 
442 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  39.27 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  39.63 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  37.46 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  37.46 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  37.39 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  37.96 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  48.05 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  37.46 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.59 
 
 
441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  36.47 
 
 
447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  40.83 
 
 
461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  39.02 
 
 
470 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  37.46 
 
 
459 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>