More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3277 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  100 
 
 
563 aa  1116    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  49.56 
 
 
536 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  46.13 
 
 
546 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
551 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  45.32 
 
 
550 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  41.78 
 
 
537 aa  335  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  37.86 
 
 
547 aa  325  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  44.69 
 
 
551 aa  317  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  37.81 
 
 
563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  39.31 
 
 
548 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.07 
 
 
668 aa  256  6e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  37.59 
 
 
566 aa  256  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.79 
 
 
583 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.88 
 
 
709 aa  254  4.0000000000000004e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.12 
 
 
585 aa  253  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.42 
 
 
644 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.32 
 
 
641 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  36.63 
 
 
562 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2465  ABC transporter related protein  36 
 
 
541 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0270517  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.82 
 
 
690 aa  243  9e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  36.08 
 
 
603 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  32.18 
 
 
552 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  33.15 
 
 
649 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.15 
 
 
659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  36.33 
 
 
632 aa  233  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.26 
 
 
636 aa  233  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  30.5 
 
 
640 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.52 
 
 
634 aa  230  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  31.17 
 
 
629 aa  229  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  30.34 
 
 
645 aa  228  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 
644 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  31.24 
 
 
636 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 
662 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  30.53 
 
 
658 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  32.43 
 
 
630 aa  227  6e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.21 
 
 
548 aa  226  8e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  28.65 
 
 
666 aa  226  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 
644 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  31.29 
 
 
632 aa  225  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 
658 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  33.27 
 
 
540 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  33.52 
 
 
632 aa  225  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  33.7 
 
 
540 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 
659 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.86 
 
 
634 aa  225  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 
658 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 
658 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 
658 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 
640 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  33.46 
 
 
645 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  33.58 
 
 
659 aa  224  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  29.48 
 
 
630 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  33.76 
 
 
641 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  32.47 
 
 
649 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  30.98 
 
 
672 aa  221  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  34.2 
 
 
532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  30.42 
 
 
632 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  31.45 
 
 
549 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  35.75 
 
 
552 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4364  ABC transporter related  30.95 
 
 
519 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.15 
 
 
540 aa  221  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  33.82 
 
 
552 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.39 
 
 
643 aa  221  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  30.55 
 
 
644 aa  220  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  33.7 
 
 
649 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  28.83 
 
 
515 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.77 
 
 
550 aa  219  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  29.62 
 
 
515 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  33.27 
 
 
533 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  30.4 
 
 
685 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  30.36 
 
 
630 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.07 
 
 
548 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  35.44 
 
 
561 aa  217  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  29.04 
 
 
544 aa  217  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.07 
 
 
548 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  33.58 
 
 
767 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.87 
 
 
645 aa  216  7e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3301  ABC transporter related  34.19 
 
 
534 aa  216  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.68 
 
 
564 aa  216  8e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  32.67 
 
 
545 aa  216  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  30.16 
 
 
664 aa  216  9e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  33.89 
 
 
633 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  30.11 
 
 
638 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1814  ABC transporter related  30.07 
 
 
513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  29.19 
 
 
638 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0250  ATPase  33.94 
 
 
662 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  29.34 
 
 
642 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  37.48 
 
 
613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  32.79 
 
 
659 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  29.34 
 
 
642 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  33.52 
 
 
669 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  32.84 
 
 
532 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  33.58 
 
 
645 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.42 
 
 
559 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  31.52 
 
 
537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  35.74 
 
 
540 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  34.95 
 
 
545 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  33.52 
 
 
548 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  30.81 
 
 
641 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  32.28 
 
 
634 aa  213  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.239651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>