139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2300 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2300  protein translocase subunit yajC  100 
 
 		 149 aa  306  5e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0562615  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  61.08 
 
 		 181 aa  187  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  41.9 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  39.81 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  40.95 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  37.25 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  30.89 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  34.82 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  32.18 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  36.08 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  34.07 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  34.13 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  30.61 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  29.59 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  29.59 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  29.9 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  28.57 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  28.57 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  28.57 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  29.47 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  28.57 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01047  preprotein translocase subunit YajC  34.57 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  30.25 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  32.56 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  30.38 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  31.25 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004366  preprotein translocase subunit YajC  32.1 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  30.86 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  32.61 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  37.66 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  28.42 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  30.21 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  35.14 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  28.42 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  33.81 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  26.05 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 		 86 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  34.02 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1314  preprotein translocase subunit YajC  32.5 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  29.41 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  33.98 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  34.02 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  35.06 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  34.94 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  31.65 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  32.43 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  28.75 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  29.29 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  30.97 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  34.52 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  32.61 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  30.69 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  32.61 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  29.79 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  31.58 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  32.61 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  30 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  32.61 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  32.61 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  30 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  32.61 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  32.61 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  25.83 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  31.86 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1229  preprotein translocase subunit YajC  30.86 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  29.63 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  32.14 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  29.47 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  32.14 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  32.14 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  35 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  32.14 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  32.14 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  32.14 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  32.14 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  32.14 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  30.39 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  28.42 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  25.22 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  33.71 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  30.93 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  31.33 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  37.04 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  34.52 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  26.74 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>