More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1977 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  289  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  57.14 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  54.89 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  54.89 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.44 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.91 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.29 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.72 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  59.26 
 
 		 145 aa  120  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.68 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.29 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  51.16 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.39 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.91 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.25 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
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NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.3 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
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NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.55 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
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NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.2 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  53.96 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  50.34 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  54.55 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
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NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  55 
 
 		 146 aa  106  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  50.76 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  52.45 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.17 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
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NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  54.76 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  45.07 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  44.85 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
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NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.87 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
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NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.85 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
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NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.96 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.15 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  52.11 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.15 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.496568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01530  peptidyl-tRNA hydrolase  35.48 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  43.94 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.13 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0215  Class I peptide chain release factor  44.96 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.01 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.94 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.65 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.18 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.18 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.18 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.18 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.18 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  43.18 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  43.18 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  41.55 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
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NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.96 
 
 		 138 aa  84.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.79 
 
 		 137 aa  83.6  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
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NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.3 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.3 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.3 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.26 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.97 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0267  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.14 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  40.6 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.14 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.14 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.14 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.14 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.6 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.13 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  43.44 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_4614  Class I peptide chain release factor  38.17 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2352  class I peptide chain release factor  40.3 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.04 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.69 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  40.15 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.69 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.77 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.31 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  38.06 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  32.26 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.58 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  40.74 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.68 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  41.73 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.06 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.06 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.68 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.06 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  36.51 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.3 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.34 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.04 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  39.1 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  35.25 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.77 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.68 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1191  Class I peptide chain release factor  38.97 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.36 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0979  Class I peptide chain release factor  50 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812989 
 
 
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NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.18 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.04 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.04 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.09 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
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