More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1653 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1653  ABC transporter related  100 
 
 
524 aa  1010    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1646  ABC transporter related  53.41 
 
 
556 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  34.31 
 
 
568 aa  243  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  33.39 
 
 
582 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  33.83 
 
 
553 aa  234  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.87 
 
 
497 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  32.08 
 
 
501 aa  216  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  32.02 
 
 
509 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  29.2 
 
 
593 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  29.1 
 
 
568 aa  210  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  30.37 
 
 
478 aa  209  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  31.93 
 
 
574 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  29.86 
 
 
647 aa  206  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  29.65 
 
 
481 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.93 
 
 
550 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  29.85 
 
 
564 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  32.17 
 
 
571 aa  200  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  29.32 
 
 
605 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  34.64 
 
 
526 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  30.67 
 
 
557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  28.39 
 
 
576 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  25.14 
 
 
574 aa  196  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  31.44 
 
 
541 aa  194  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  31.15 
 
 
510 aa  192  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  31.84 
 
 
571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  27.95 
 
 
568 aa  190  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  27.2 
 
 
569 aa  187  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  27.31 
 
 
501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  26.54 
 
 
566 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  28.95 
 
 
548 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  30.81 
 
 
628 aa  184  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  30.48 
 
 
581 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  25.6 
 
 
566 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  28.88 
 
 
581 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  27.59 
 
 
569 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  29.91 
 
 
587 aa  180  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  27.41 
 
 
569 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  25.84 
 
 
566 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.61 
 
 
627 aa  179  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  27.33 
 
 
593 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  25.65 
 
 
566 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  27.13 
 
 
579 aa  178  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  33.15 
 
 
547 aa  177  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  25.69 
 
 
566 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  25.51 
 
 
566 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  25.32 
 
 
566 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  25.51 
 
 
566 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  28.16 
 
 
531 aa  173  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  25.14 
 
 
566 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  31.56 
 
 
495 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  28.79 
 
 
469 aa  171  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  27.31 
 
 
551 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  28.38 
 
 
537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  26.82 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2059  ABC transporter related  27.83 
 
 
506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0776584 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  27.49 
 
 
553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  32.89 
 
 
535 aa  164  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.57 
 
 
770 aa  164  5.0000000000000005e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  32.95 
 
 
482 aa  163  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  29.71 
 
 
534 aa  163  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.07 
 
 
495 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  29.96 
 
 
471 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  27.86 
 
 
551 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.09 
 
 
562 aa  161  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  31.37 
 
 
458 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  32.37 
 
 
491 aa  160  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28.73 
 
 
810 aa  160  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  27.57 
 
 
551 aa  160  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.81 
 
 
558 aa  157  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  27.48 
 
 
553 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  27.53 
 
 
551 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  27.46 
 
 
551 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  31.49 
 
 
517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.31 
 
 
551 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.53 
 
 
590 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  24.65 
 
 
630 aa  153  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4449  ABC transporter related  27.67 
 
 
456 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  30.37 
 
 
540 aa  153  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  27.29 
 
 
553 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.53 
 
 
553 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  31.96 
 
 
574 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0090  ABC transporter related  27.7 
 
 
456 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  27.95 
 
 
512 aa  152  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  29.54 
 
 
494 aa  150  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  28.97 
 
 
449 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4254  ABC transporter related  28.36 
 
 
456 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  27.77 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  31.32 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  27.67 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  31.08 
 
 
539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  38.5 
 
 
282 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  31.32 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  30.06 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  31.4 
 
 
966 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  33.79 
 
 
512 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  34.54 
 
 
541 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  30.11 
 
 
498 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  29.17 
 
 
500 aa  144  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  32.27 
 
 
488 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  27.1 
 
 
549 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>