More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0396 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  43.26 
 
 		 296 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  48.91 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  45.59 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  43.92 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  46.27 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  46.81 
 
 		 293 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  44.37 
 
 		 293 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  45.07 
 
 		 296 aa  97.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  46.21 
 
 		 308 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  47.55 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 		 294 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 		 293 aa  92  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  42.65 
 
 		 339 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  46.26 
 
 		 303 aa  90.9  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 293 aa  90.5  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2071  UspA domain protein  50 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000068593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  42.04 
 
 		 317 aa  89.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  39.07 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  43.97 
 
 		 192 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  46.81 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  39.13 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  44.06 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  42 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  39.24 
 
 		 321 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 		 343 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  40 
 
 		 324 aa  80.9  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  43.57 
 
 		 310 aa  80.9  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  41.01 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  41.01 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  40.88 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  39.29 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  41.01 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  41.43 
 
 		 347 aa  78.2  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  40.54 
 
 		 303 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  40.82 
 
 		 291 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  44.37 
 
 		 296 aa  77.8  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  41.5 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  37.24 
 
 		 285 aa  77.4  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  40.94 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  36.6 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  41.96 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  45.32 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  39.58 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 300 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 289 aa  74.7  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  36.84 
 
 		 306 aa  74.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  42.34 
 
 		 296 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  39.57 
 
 		 293 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  42.57 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 289 aa  73.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  42.96 
 
 		 289 aa  73.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  39.74 
 
 		 298 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 298 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 		 276 aa  73.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 298 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  42 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  39.87 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  34 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  40.4 
 
 		 292 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  36.43 
 
 		 345 aa  72  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  36.3 
 
 		 294 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  38.73 
 
 		 293 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 294 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 		 293 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 287 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  37.97 
 
 		 294 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.46 
 
 		 288 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 295 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  39.86 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  39.6 
 
 		 292 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 		 292 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 293 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 289 aa  70.5  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  38.13 
 
 		 293 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  42.55 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  39.38 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  34.56 
 
 		 341 aa  68.6  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 297 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.5 
 
 		 288 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  39.85 
 
 		 297 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  34.85 
 
 		 294 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  34.85 
 
 		 294 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.76 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  36.57 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  36.5 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>