More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0712 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0712  peptidase M50  100 
 
 		 456 aa  925    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41926  hitchhiker  0.0000525349 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.35 
 
 		 424 aa  142  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0981  peptidase RseP  28.05 
 
 		 421 aa  136  8e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.103609  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  27.79 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0246  membrane-associated Zn-dependent protease 1  25.71 
 
 		 420 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  30.5 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  26.64 
 
 		 420 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  26.64 
 
 		 420 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  26.64 
 
 		 420 aa  124  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.64 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  26.64 
 
 		 420 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  26.3 
 
 		 417 aa  124  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  30.11 
 
 		 347 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.41 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.41 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.41 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  26.41 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10880  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  34.84 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.65 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0923796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.77 
 
 		 418 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  27.23 
 
 		 422 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.94 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  26.64 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  30.25 
 
 		 354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.59 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  26.06 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  28.97 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  25.99 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2466  peptidase M50  31.4 
 
 		 364 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0807  membrane-associated Zn-dependent protease 1  25.55 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234706  hitchhiker  0.000000563759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  26.65 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  26.3 
 
 		 354 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.19 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.19 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23570  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  35.44 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.127654  normal  0.0171922 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.53 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.07 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  28.03 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  27.27 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  29.15 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.85 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  30 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  28.07 
 
 		 354 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.93 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.95 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  27.4 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  25.54 
 
 		 448 aa  99.8  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3629  peptidase M50  29.18 
 
 		 325 aa  99.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.84 
 
 		 383 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  30 
 
 		 386 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.97 
 
 		 368 aa  99.8  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.17 
 
 		 343 aa  99.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  26.5 
 
 		 354 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  27.95 
 
 		 380 aa  99  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  29.51 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.21 
 
 		 380 aa  98.2  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  31.36 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.21 
 
 		 355 aa  97.8  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.32 
 
 		 383 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  28.2 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.26 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.8 
 
 		 456 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.57 
 
 		 339 aa  95.5  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  28.67 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.64 
 
 		 455 aa  95.5  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  28.67 
 
 		 379 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  28.67 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  29.37 
 
 		 386 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.1 
 
 		 383 aa  94.4  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.99 
 
 		 350 aa  94  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  26.08 
 
 		 454 aa  93.6  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  26.77 
 
 		 342 aa  93.6  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1972  hypothetical protein  28.57 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.31127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.58 
 
 		 456 aa  93.2  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.87 
 
 		 361 aa  93.2  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.58 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.38 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.14 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  24.34 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.33 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.57 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  29.2 
 
 		 337 aa  92.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.48 
 
 		 367 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  25.63 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  24.95 
 
 		 451 aa  91.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  28.93 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.11 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0037  peptidase M50  25.88 
 
 		 501 aa  90.9  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0037  peptidase M50  25.88 
 
 		 501 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.31 
 
 		 439 aa  90.5  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  29.5 
 
 		 384 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  25.09 
 
 		 375 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.83 
 
 		 372 aa  90.1  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.6 
 
 		 383 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.04 
 
 		 351 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  30.63 
 
 		 439 aa  90.1  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.19 
 
 		 457 aa  89.7  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  27.36 
 
 		 351 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  28.38 
 
 		 461 aa  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  26.6 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>