222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7076 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  71.35 
 
 		 198 aa  274  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  55.32 
 
 		 201 aa  214  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  57.67 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  54.26 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  54.26 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  54.26 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  52.66 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  53.19 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  51.35 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  53.51 
 
 		 190 aa  177  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  52.36 
 
 		 187 aa  167  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  48.39 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  49.17 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  48.66 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  45.95 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  45.5 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  50.83 
 
 		 184 aa  150  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  45.45 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  45.5 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  49.46 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  44.86 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  48.39 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  43.65 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  46.19 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  40.88 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  39.79 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  33.51 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 182 aa  97.8  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  33.85 
 
 		 186 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  39.13 
 
 		 184 aa  91.3  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  32.45 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  36.63 
 
 		 188 aa  89  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  31.35 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  30.27 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  30.56 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  32.61 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  31.67 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  30.81 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  28.42 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  30.81 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  29.38 
 
 		 216 aa  80.9  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  33.51 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  29.69 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  32.1 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  28.89 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  29.59 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  30.11 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  30.48 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  29.89 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  28.18 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  25.27 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  28.42 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  29.89 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  29.89 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  27.07 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  26.74 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  29.21 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  28.89 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  23.89 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  29.3 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  29.19 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  28.07 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  29.3 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  29.94 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  27.68 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  27.78 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  28.33 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  27.78 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  29.35 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  29.89 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  27.07 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  27.75 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  28.32 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  29.02 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  29.82 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  32.8 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  27.68 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  28.21 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  28.04 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  29.7 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  28.49 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  30.81 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  31.61 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  29.83 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  27.69 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  29.32 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  30.9 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  28.09 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  28.12 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  29.89 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>