83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5107 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 171 aa  352  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  55.81 
 
 		 262 aa  207  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  61.27 
 
 		 244 aa  202  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  59.41 
 
 		 266 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  61.05 
 
 		 245 aa  194  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  57.83 
 
 		 266 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  53.85 
 
 		 172 aa  190  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  60.96 
 
 		 183 aa  184  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  52.35 
 
 		 356 aa  180  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  54.39 
 
 		 251 aa  177  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  57.75 
 
 		 338 aa  174  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  44.71 
 
 		 651 aa  150  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  39.2 
 
 		 197 aa  124  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  41.57 
 
 		 313 aa  123  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  39.39 
 
 		 201 aa  121  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  40.3 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.52 
 
 		 477 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.9 
 
 		 481 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.9 
 
 		 481 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.63 
 
 		 481 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.32 
 
 		 491 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.9 
 
 		 481 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.5 
 
 		 491 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.5 
 
 		 491 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 458 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.5 
 
 		 486 aa  98.2  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  35.23 
 
 		 221 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  35.23 
 
 		 221 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.91 
 
 		 473 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  29.8 
 
 		 455 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 197 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  29.8 
 
 		 455 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.95 
 
 		 481 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  28.65 
 
 		 458 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 221 aa  95.5  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  34.72 
 
 		 221 aa  95.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  34.72 
 
 		 221 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  29.29 
 
 		 455 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  34.72 
 
 		 221 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  34.72 
 
 		 221 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  34.72 
 
 		 221 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  34.72 
 
 		 221 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  34.72 
 
 		 221 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  29.59 
 
 		 455 aa  94.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  29.29 
 
 		 455 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  30.3 
 
 		 455 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  29.15 
 
 		 455 aa  94  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  29.15 
 
 		 455 aa  94  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  29.63 
 
 		 456 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  28.79 
 
 		 455 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  28.79 
 
 		 455 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  28.72 
 
 		 459 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  28.28 
 
 		 455 aa  91.3  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  29.29 
 
 		 456 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 216 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.69 
 
 		 471 aa  87.8  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.83 
 
 		 491 aa  87  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  30.24 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.69 
 
 		 487 aa  80.9  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.22 
 
 		 485 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  31.64 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.42 
 
 		 497 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  27.51 
 
 		 445 aa  67.8  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  29.38 
 
 		 285 aa  60.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  25.35 
 
 		 307 aa  50.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  21.81 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  27.4 
 
 		 438 aa  47.4  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  23.56 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  24.26 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  25.41 
 
 		 214 aa  44.3  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  24.59 
 
 		 233 aa  44.3  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  24.59 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  24.59 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  24.59 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  24.59 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  24.59 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  29.11 
 
 		 391 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  26.76 
 
 		 390 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  24.59 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  22.51 
 
 		 464 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  26.89 
 
 		 220 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  24.44 
 
 		 359 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  21.99 
 
 		 465 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>