51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2426 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  100 
 
 		 269 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  54.44 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  55.21 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  48.85 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  54.22 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  51.17 
 
 		 268 aa  218  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  47.97 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  46.49 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  44.93 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  47.49 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  45.38 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  44.69 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  43.46 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  46.24 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  43.68 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  47.3 
 
 		 277 aa  191  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  43.08 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  41.39 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  41.63 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  40.7 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  44.59 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  41.48 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  39.47 
 
 		 278 aa  185  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  39.83 
 
 		 315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  39.85 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  39.85 
 
 		 300 aa  152  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  31.92 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  34.69 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  31.73 
 
 		 274 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  31.29 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  30.21 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  33.98 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  31.66 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  31.36 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  37.18 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  30.77 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  29.43 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  32.13 
 
 		 415 aa  122  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  29.55 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  32.09 
 
 		 718 aa  105  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  28.41 
 
 		 1701 aa  95.5  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  32.42 
 
 		 469 aa  93.6  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  26.59 
 
 		 938 aa  89  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  27.07 
 
 		 1546 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  29.02 
 
 		 2028 aa  70.1  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  26.86 
 
 		 1012 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  22.58 
 
 		 2110 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  24.9 
 
 		 1742 aa  55.8  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  20.1 
 
 		 2206 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  23.57 
 
 		 256 aa  45.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  20.83 
 
 		 533 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>