More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3311 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  641    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  99.38 
 
 		 324 aa  637    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  72.87 
 
 		 327 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  70.57 
 
 		 334 aa  434  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  73.75 
 
 		 332 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  72.05 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  64.35 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  41.64 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  41.32 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  40.07 
 
 		 343 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  38.67 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  37.99 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  39.26 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  37.8 
 
 		 355 aa  198  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  38.33 
 
 		 331 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  37.63 
 
 		 330 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  38.31 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  36.89 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  36.25 
 
 		 334 aa  195  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  34.94 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.25 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  38.72 
 
 		 329 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  36.92 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.37 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  36.43 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  36.39 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.04 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.7 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.18 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  36.42 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  39.32 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  36.58 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  38.97 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  37.71 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  35.86 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  34.25 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  37.71 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  34.88 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  34.72 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  35.69 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  35.23 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  36.79 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  33.67 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  34.67 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  32.92 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  36.3 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.39 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.01 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  36.61 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  36.39 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4067  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0118561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  32.52 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  35.65 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  35.91 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  35.81 
 
 		 330 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  38.05 
 
 		 326 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.69 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  32.66 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  36.16 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  34.01 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.66 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  37.97 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  34.37 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  35.23 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  37.97 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  34.49 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.3 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.24 
 
 		 331 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  32.73 
 
 		 321 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  35.84 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  34.04 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  34.69 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  35.62 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  36.59 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  35 
 
 		 353 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  34.89 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  34.11 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  35.99 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  31.85 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  35 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  33.55 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.87 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  34.67 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  34.06 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  34.46 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  32.82 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  32.82 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  33.11 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  32.67 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  36.6 
 
 		 331 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  31.51 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.09 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  32.89 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  32.33 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  30.84 
 
 		 330 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  33.67 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  34.05 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  33.9 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>