128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0121 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  100 
 
 
297 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  96.3 
 
 
297 aa  551  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  86.87 
 
 
297 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  86.53 
 
 
315 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  54.21 
 
 
285 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  52.01 
 
 
290 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  47.81 
 
 
291 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  50.34 
 
 
286 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  52.56 
 
 
288 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  50 
 
 
289 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  51.34 
 
 
291 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  49.15 
 
 
288 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.55 
 
 
283 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.71 
 
 
286 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  48.32 
 
 
289 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  37.29 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.61 
 
 
286 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  36.95 
 
 
286 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  36.79 
 
 
286 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  43.02 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.18 
 
 
282 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  39.4 
 
 
290 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  35.59 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  40.65 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  39.26 
 
 
285 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40 
 
 
283 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  38.25 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  39.64 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.55 
 
 
278 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  40.16 
 
 
285 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  39.08 
 
 
289 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  39.08 
 
 
289 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  36 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  38.7 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  35.02 
 
 
286 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  37.04 
 
 
286 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  35.76 
 
 
893 aa  143  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  38.61 
 
 
287 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
710 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  34.56 
 
 
286 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  34.56 
 
 
286 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  34.56 
 
 
286 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  37.07 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  35.19 
 
 
903 aa  132  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  32.06 
 
 
283 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  31.95 
 
 
316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  31.34 
 
 
901 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  34.63 
 
 
265 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  31.18 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  30.11 
 
 
290 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  34.24 
 
 
295 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  29.74 
 
 
283 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  30.11 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  32.04 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  38.83 
 
 
135 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  24.42 
 
 
317 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  27.68 
 
 
337 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  38.46 
 
 
146 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 
135 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 
135 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  32.72 
 
 
3077 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  32.72 
 
 
3077 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  32.72 
 
 
3075 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  41.43 
 
 
2111 aa  52.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  33.65 
 
 
154 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0858  putative dehydratase  44.62 
 
 
127 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586377  normal  0.419357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  33.05 
 
 
141 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  28.23 
 
 
141 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2532  dehydratase  29.68 
 
 
3087 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  35.06 
 
 
148 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  34.72 
 
 
1872 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  35.06 
 
 
156 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12545  fatty acid synthase fas  32.43 
 
 
3069 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.696473  decreased coverage  0.00343939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  27.74 
 
 
3097 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  32.86 
 
 
151 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  41.1 
 
 
137 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  26.27 
 
 
147 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  29.81 
 
 
139 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  29.38 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  28.93 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  30.1 
 
 
184 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  28.87 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  29.35 
 
 
145 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
140 aa  47  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  31.17 
 
 
152 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  26.74 
 
 
135 aa  46.2  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  30.26 
 
 
147 aa  45.8  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  33.33 
 
 
134 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  31.96 
 
 
147 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  28.18 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  28.97 
 
 
173 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  26.62 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  32.61 
 
 
140 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  35.94 
 
 
143 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  44.07 
 
 
131 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  27.59 
 
 
148 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1753  dehydratase  35.21 
 
 
133 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.674213  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  29.09 
 
 
147 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  29.09 
 
 
147 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>