More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1770 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1770  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
512 aa  1005    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1059  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.26 
 
 
569 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.773265 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0530  Acyl-CoA dehydrogenase  41.22 
 
 
560 aa  277  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0204  acyl-CoA dehydrogenase  42.05 
 
 
564 aa  277  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0731517  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.77 
 
 
560 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05445  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  41.94 
 
 
551 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.14 
 
 
562 aa  273  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181987  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2228  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.14 
 
 
562 aa  273  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489531  normal  0.489903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.05 
 
 
560 aa  273  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.98 
 
 
555 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2186  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.14 
 
 
562 aa  270  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0552217  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2444  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.06 
 
 
567 aa  269  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.590306  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  42.28 
 
 
548 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.37 
 
 
568 aa  267  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.65 
 
 
555 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3064  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.11 
 
 
563 aa  266  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  43.8 
 
 
560 aa  266  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0310  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.35 
 
 
563 aa  262  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0589554  normal  0.08283 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3795  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.81 
 
 
528 aa  257  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2897  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  40.85 
 
 
527 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  35.75 
 
 
400 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  35.75 
 
 
388 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.76 
 
 
385 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  34.97 
 
 
388 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.34 
 
 
385 aa  227  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.18 
 
 
386 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  36.22 
 
 
399 aa  217  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.46 
 
 
384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.63 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.43 
 
 
412 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  35.14 
 
 
385 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.6 
 
 
398 aa  209  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.7 
 
 
379 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  34.79 
 
 
385 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  34.79 
 
 
385 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  34.79 
 
 
385 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  35.7 
 
 
385 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.86 
 
 
386 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.13 
 
 
379 aa  206  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.91 
 
 
386 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.48 
 
 
399 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.32 
 
 
380 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.66 
 
 
379 aa  203  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.88 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.55 
 
 
383 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.14 
 
 
380 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  33.83 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.26 
 
 
387 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  34.09 
 
 
376 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  34.09 
 
 
376 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.01 
 
 
387 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.83 
 
 
400 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.2 
 
 
386 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.22 
 
 
398 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.52 
 
 
386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  34.09 
 
 
376 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  34.09 
 
 
376 aa  200  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  34.09 
 
 
376 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  35.42 
 
 
383 aa  200  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.09 
 
 
376 aa  200  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.76 
 
 
389 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.34 
 
 
376 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  33.83 
 
 
376 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  33.83 
 
 
381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  33.58 
 
 
381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.51 
 
 
385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.58 
 
 
383 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.16 
 
 
383 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.85 
 
 
389 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.98 
 
 
395 aa  196  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0103  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.27 
 
 
393 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.52 
 
 
390 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.59 
 
 
383 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.91 
 
 
396 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.4 
 
 
393 aa  195  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.91 
 
 
396 aa  194  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.59 
 
 
381 aa  194  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5152  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.34 
 
 
381 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.276621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5991  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.4 
 
 
395 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3247  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.16 
 
 
381 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0135  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.48 
 
 
393 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  32.65 
 
 
379 aa  193  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.16 
 
 
381 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107231  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3185  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  34.16 
 
 
381 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.77 
 
 
397 aa  193  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  34.37 
 
 
397 aa  193  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0838  butyryl-CoA dehydrogenase  34.01 
 
 
410 aa  192  9e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.99 
 
 
381 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.42 
 
 
398 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.1 
 
 
397 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4074  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34 
 
 
381 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.94 
 
 
400 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.7 
 
 
384 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.76 
 
 
393 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1436  butyryl-CoA dehydrogenase  33.76 
 
 
410 aa  192  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.170652  hitchhiker  0.00553945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  34.93 
 
 
385 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  33.77 
 
 
383 aa  192  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  33.77 
 
 
383 aa  192  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4827  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.5 
 
 
382 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.5 
 
 
393 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>