More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1495 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1495  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 		 361 aa  705    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0842973  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.7 
 
 		 368 aa  229  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.5 
 
 		 406 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  44.02 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40.79 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.95 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.66 
 
 		 373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.82 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  40.05 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  42.74 
 
 		 390 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1002  cystathionine gamma-synthase  46.67 
 
 		 380 aa  209  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.13 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.51 
 
 		 372 aa  205  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0324  Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme superfamily protein  35.81 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00819795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  40.69 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  40.83 
 
 		 378 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  45.67 
 
 		 390 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  41.72 
 
 		 392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  42.58 
 
 		 398 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  39.72 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  42.14 
 
 		 378 aa  199  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  40.44 
 
 		 394 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  39.58 
 
 		 387 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  39.58 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  39.89 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  40.17 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  39.34 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  39.29 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.1 
 
 		 378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59680  predicted protein  37.38 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0617812 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  39.82 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  39.89 
 
 		 381 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  34.78 
 
 		 384 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  40.12 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  38.99 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  39.12 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  38.25 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1762  methionine gamma-lyase (L-methioninase)  37.69 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000846941  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  36.07 
 
 		 392 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  36.87 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1872  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.83 
 
 		 358 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.635942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  39.82 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  40.24 
 
 		 394 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  34.78 
 
 		 384 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1425  cystathionine gamma-lyase  42.9 
 
 		 400 aa  192  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.144406  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  39.82 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  39.82 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  39.82 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  39.82 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4220  cystathionine gamma-lyase  40.92 
 
 		 369 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1793  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.73 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  42.52 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  40.24 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  36 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  41.25 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  39.82 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  40.18 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  38.53 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  41.84 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  38.1 
 
 		 393 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  38.58 
 
 		 379 aa  189  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11168  cystathionine gamma-synthase (AFU_orthologue; AFUA_7G01590)  36.21 
 
 		 401 aa  189  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53049  normal  0.955075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1684  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.23 
 
 		 410 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2084  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  44.28 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  38.53 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  37.6 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  37.98 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  38.28 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  36.28 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  38.71 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  38.99 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  38.78 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00681  transulfuration enzyme family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13810)  38.1 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  38.17 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  39.94 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  34.5 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  37.87 
 
 		 393 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  38.82 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  40.12 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  38.78 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  37.77 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  38.14 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  41.37 
 
 		 423 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  35.49 
 
 		 401 aa  185  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22690  cystathionine gamma-lyase  42.99 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1928  cystathionine gamma-lyase  41.67 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1974  cystathionine gamma-lyase  41.67 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  41.37 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  34.31 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  37.57 
 
 		 386 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  39 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  36.18 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  34.25 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  37.94 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1908  cystathionine gamma-lyase  41.36 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  40.29 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  35.61 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  36.61 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  39.83 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  40.87 
 
 		 378 aa  182  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>