More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1450 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1450  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 762 aa  1483    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.76 
 
 		 438 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  30.96 
 
 		 468 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  32.71 
 
 		 994 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  30.35 
 
 		 468 aa  197  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  32.29 
 
 		 1005 aa  197  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  31.14 
 
 		 1008 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  30.97 
 
 		 1011 aa  190  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  31.84 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  30.98 
 
 		 1011 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  35.43 
 
 		 470 aa  189  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.98 
 
 		 458 aa  189  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.36 
 
 		 497 aa  187  8e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  31.6 
 
 		 468 aa  187  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  30.58 
 
 		 464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  32.78 
 
 		 994 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  33.88 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.74 
 
 		 466 aa  184  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  32.42 
 
 		 470 aa  184  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  33.41 
 
 		 477 aa  183  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.3 
 
 		 476 aa  183  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.16 
 
 		 466 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.42 
 
 		 457 aa  182  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.25 
 
 		 469 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.34 
 
 		 467 aa  181  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  34.3 
 
 		 469 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  29.25 
 
 		 503 aa  181  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  31.57 
 
 		 465 aa  180  8e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.44 
 
 		 480 aa  180  9e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  28.62 
 
 		 674 aa  180  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  28.88 
 
 		 674 aa  180  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.27 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.56 
 
 		 465 aa  179  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.61 
 
 		 467 aa  179  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.73 
 
 		 476 aa  179  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  32.11 
 
 		 462 aa  178  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  32.22 
 
 		 469 aa  178  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  31.51 
 
 		 468 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  30.97 
 
 		 473 aa  178  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  30.36 
 
 		 465 aa  178  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  32.14 
 
 		 469 aa  177  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  31.74 
 
 		 463 aa  177  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.46 
 
 		 469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  29.66 
 
 		 470 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  30.62 
 
 		 476 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.51 
 
 		 463 aa  174  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  32.92 
 
 		 455 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2969  putative oxidoreductase  34.29 
 
 		 411 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.765819  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  34.06 
 
 		 467 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.29 
 
 		 464 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  33.2 
 
 		 476 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  28.35 
 
 		 761 aa  172  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 481 aa  171  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.08 
 
 		 447 aa  171  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  34.81 
 
 		 468 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  29.09 
 
 		 480 aa  171  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  29.05 
 
 		 639 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.22 
 
 		 639 aa  169  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  29.22 
 
 		 639 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.22 
 
 		 639 aa  169  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.22 
 
 		 641 aa  169  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  30.08 
 
 		 473 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.13 
 
 		 463 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.22 
 
 		 639 aa  168  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.87 
 
 		 466 aa  167  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  30.71 
 
 		 469 aa  167  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2791  glutamate synthase subunit beta  30.54 
 
 		 485 aa  167  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  31.4 
 
 		 476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.05 
 
 		 644 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.26 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  30.18 
 
 		 485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  30.59 
 
 		 468 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.23 
 
 		 457 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  27.85 
 
 		 598 aa  166  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  30.8 
 
 		 468 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  28.99 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  30.59 
 
 		 468 aa  164  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  30.8 
 
 		 468 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  28.37 
 
 		 477 aa  163  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.62 
 
 		 448 aa  163  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  34.58 
 
 		 472 aa  162  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.41 
 
 		 658 aa  162  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  32.68 
 
 		 473 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  30.64 
 
 		 472 aa  161  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  30.56 
 
 		 469 aa  161  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  28.35 
 
 		 671 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.22 
 
 		 1487 aa  160  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  31.46 
 
 		 468 aa  160  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  33.69 
 
 		 472 aa  160  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  33.96 
 
 		 472 aa  160  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  30.62 
 
 		 469 aa  160  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  34.32 
 
 		 472 aa  160  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  33.68 
 
 		 469 aa  160  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  28.31 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  33.78 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  33.78 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  33.24 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  33.78 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  34.32 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  34.32 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>