More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1215 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1215  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
351 aa  672    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.423128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.29 
 
 
351 aa  409  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  61.98 
 
 
346 aa  398  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  59.75 
 
 
342 aa  396  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  60.71 
 
 
355 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.64 
 
 
333 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.75 
 
 
353 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.22 
 
 
336 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.64 
 
 
348 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 
342 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.57 
 
 
344 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 
352 aa  375  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.04 
 
 
355 aa  376  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.01 
 
 
336 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  60 
 
 
541 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
336 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
336 aa  371  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
336 aa  371  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
333 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.15 
 
 
344 aa  368  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 
333 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
333 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.75 
 
 
341 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
336 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 
333 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 
353 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
333 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 
333 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.46 
 
 
370 aa  368  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 
357 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 
360 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 
355 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
333 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.13 
 
 
364 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.35 
 
 
337 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.69 
 
 
363 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.81 
 
 
348 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.04 
 
 
337 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.01 
 
 
354 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 
354 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 
357 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 
357 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 
335 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 
338 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 
357 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.82 
 
 
340 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 
337 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.46 
 
 
338 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.35 
 
 
338 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.5 
 
 
367 aa  363  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.43 
 
 
366 aa  363  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.44 
 
 
345 aa  363  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.27 
 
 
338 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 
350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.34 
 
 
382 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3181  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.75 
 
 
338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.69 
 
 
347 aa  362  8e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 
355 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.84 
 
 
349 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.63 
 
 
359 aa  361  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 
358 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.91 
 
 
346 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.57 
 
 
344 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.13 
 
 
350 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 
338 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 
338 aa  359  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.83 
 
 
321 aa  359  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  57.49 
 
 
374 aa  359  5e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.28 
 
 
353 aa  358  5e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.17 
 
 
351 aa  358  5e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.17 
 
 
351 aa  358  5e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.57 
 
 
355 aa  358  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 
338 aa  358  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 
345 aa  358  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.01 
 
 
339 aa  358  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0561  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 
348 aa  357  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.389647  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.6 
 
 
346 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.33 
 
 
368 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0928  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0629  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.03 
 
 
339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.151039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.4 
 
 
343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.22 
 
 
363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.39 
 
 
351 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 
347 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 
355 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1267  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.65 
 
 
327 aa  355  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.330108  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  55 
 
 
349 aa  355  5e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.76 
 
 
351 aa  355  5e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.74 
 
 
344 aa  355  5e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.46 
 
 
347 aa  355  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.04 
 
 
345 aa  355  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.5 
 
 
345 aa  355  6.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0881  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 
329 aa  355  8.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.67624  normal  0.7592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 
330 aa  354  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 
333 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 
340 aa  353  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.46 
 
 
337 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 
367 aa  353  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>