More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0331 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 322 aa  659    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  79.87 
 
 		 324 aa  527  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  79.11 
 
 		 321 aa  522  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  76.32 
 
 		 324 aa  519  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  74.29 
 
 		 330 aa  498  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  74.68 
 
 		 325 aa  494  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.35 
 
 		 323 aa  438  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.24 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.78 
 
 		 368 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.62 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.32 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.39 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.8 
 
 		 331 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.82 
 
 		 368 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.27 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.54 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.84 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.4 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.37 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.51 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.88 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.05 
 
 		 345 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.51 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.57 
 
 		 328 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.99 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.67 
 
 		 359 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.21 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.63 
 
 		 329 aa  381  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.61 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.19 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.19 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.21 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.21 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.58 
 
 		 323 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.21 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  55.26 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.77 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.26 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.27 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.76 
 
 		 326 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.18 
 
 		 327 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.62 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.85 
 
 		 340 aa  374  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  55.62 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4448  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3210  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.88 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.63 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.18 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.56 
 
 		 328 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.08 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.38 
 
 		 323 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.19 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.09 
 
 		 340 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.86 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.18 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0626  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.36 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  56.02 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.78 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.78 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.78 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.39 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.78 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.19 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.02 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.78 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 		 344 aa  368  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.89 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.78 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.89 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.89 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.19 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.06 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  57.94 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.03 
 
 		 344 aa  364  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.62 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.89 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3814  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.41 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953325  normal  0.405066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.19 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0340  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.78 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000850961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.14 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1701  GDP-mannose 4,6 dehydratase  54.79 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.286403  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.85 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1630  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.79 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333823  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.76 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 		 346 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.79 
 
 		 347 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6329  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.71 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.28 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.79 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2097  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.49 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822363  hitchhiker  0.0000115306 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.29 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.63 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.12 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.98 
 
 		 353 aa  359  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.4 
 
 		 348 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.93 
 
 		 344 aa  359  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1523  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.41 
 
 		 373 aa  358  8e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1316  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.57 
 
 		 367 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>