220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3332 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3332  cytochrome B561  100 
 
 		 181 aa  350  8.999999999999999e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  39.87 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  38.01 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.01 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  38.61 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  40.25 
 
 		 186 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  40.25 
 
 		 186 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  40.25 
 
 		 186 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  37.97 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  36.71 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  40.91 
 
 		 206 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  35.8 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  38.32 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.12 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  35.2 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  34.29 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  34.57 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  33.88 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  38.64 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  38.64 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  38.64 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  36.65 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  37.72 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  38.64 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  38.64 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  38.64 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.64 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  37.88 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  32.96 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  36.99 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  34.18 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  33.54 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  35.44 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  33.54 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  33.93 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  35.96 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  35.43 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.33 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  36.53 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  34.59 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.12 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  31.64 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  31.82 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  33.15 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  33.97 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  32.1 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  31.87 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  35.29 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.95 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  27.54 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  35.76 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  32.95 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.36 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  36.14 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  37.93 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  31.52 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6481  cytochrome B561  30.41 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156501  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6716  cytochrome B561  30.41 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.405595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  29.3 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  36.84 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  33.53 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3330  cytochrome B561  35.5 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  31.17 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  28.92 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  31.58 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  30.97 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  33.12 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0137  cytochrome B561  36.81 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0274557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  28.81 
 
 		 420 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  33.13 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  31.85 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  34.33 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  32.95 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  29.94 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  32.57 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  31.61 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  32.12 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  33.54 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.07 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  34.33 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  31.65 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  30.52 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  32.6 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  31.65 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1770  cytochrome B561  35.71 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0412177  normal  0.670754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  31.22 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  30.52 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2495  cytochrome B561  32.48 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.512394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2101  cytochrome B561  32.48 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  32.04 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  33.58 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  30.77 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  30.59 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  31.85 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  33.33 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  32.09 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  28.05 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  34.15 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  29.41 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.05 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>